41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1817 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  100 
 
 		 98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  47.52 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  45.54 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  43.68 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  43.62 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  40.95 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  40 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  38.54 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  37.62 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  34.65 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  34.65 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2802  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  33.68 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0578  cytochrome c-553  37.5 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 103 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  33.66 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  37.78 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  37.74 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  38.83 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  37.76 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  26.88 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  40 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  33.33 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  32.04 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2894  cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 226 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  32.69 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  38.36 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  38.36 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  32.69 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  38.36 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  29.55 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  24.75 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003775  cytochrome c553  31.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  36.11 
 
 		 213 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 216 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0398  cytochrome c family protein, putative  30.12 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1602  cytochrome c553  30.95 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.330816  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0431  cytochrome c class I  39.64 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  5.40538e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>