More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0307 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
309 aa  625  1e-178  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  85.39 
 
 
309 aa  544  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 
309 aa  534  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.14 
 
 
309 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 
309 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  81.55 
 
 
309 aa  533  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.44 
 
 
309 aa  533  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.17 
 
 
309 aa  529  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80.06 
 
 
311 aa  520  1e-146  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  75.97 
 
 
308 aa  491  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 
313 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.59 
 
 
310 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.59 
 
 
310 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.59 
 
 
310 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
324 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.26 
 
 
313 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 
313 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 
313 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.61 
 
 
310 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
316 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.26 
 
 
310 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.97 
 
 
313 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.97 
 
 
313 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  58.39 
 
 
321 aa  374  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  58.06 
 
 
319 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
321 aa  374  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
316 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.44 
 
 
315 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.42 
 
 
316 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  57.37 
 
 
312 aa  371  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 
314 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
316 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
325 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.12 
 
 
315 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.12 
 
 
319 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
323 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
316 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.92 
 
 
315 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.02 
 
 
314 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.82 
 
 
315 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
314 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
314 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
324 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.74 
 
 
324 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0421  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.7 
 
 
314 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57 
 
 
320 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
315 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.01 
 
 
313 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.63 
 
 
316 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
315 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
332 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
311 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  56.41 
 
 
313 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
314 aa  364  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
314 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
315 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
316 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  363  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.96 
 
 
325 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  363  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  363  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
315 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57 
 
 
315 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57 
 
 
315 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
318 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
314 aa  362  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.1 
 
 
315 aa  362  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.58 
 
 
324 aa  362  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.09 
 
 
316 aa  362  4e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
317 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.22 
 
 
321 aa  362  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.41 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.41 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.41 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.41 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
317 aa  362  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
320 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
320 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.58 
 
 
324 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
320 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  56.55 
 
 
315 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.78 
 
 
321 aa  360  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.83 
 
 
315 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  361  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
314 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.14 
 
 
316 aa  360  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 
337 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
312 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>