257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1888 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  100 
 
 
212 aa  436  1e-122  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  100 
 
 
212 aa  436  1e-122  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.27737e-06  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  100 
 
 
212 aa  436  1e-122  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  5.11378e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  99.53 
 
 
212 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  98.11 
 
 
212 aa  430  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  98.11 
 
 
212 aa  430  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  98.11 
 
 
212 aa  430  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  98.11 
 
 
212 aa  430  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  98.11 
 
 
212 aa  430  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  92.45 
 
 
212 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  89.15 
 
 
212 aa  391  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  87.74 
 
 
212 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  87.74 
 
 
211 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  85.85 
 
 
211 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  86.79 
 
 
211 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  84.83 
 
 
211 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  74.64 
 
 
213 aa  328  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  72.73 
 
 
215 aa  325  4e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  71.7 
 
 
212 aa  323  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  76.08 
 
 
219 aa  322  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  75.6 
 
 
213 aa  318  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  70.33 
 
 
213 aa  317  8e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  70.33 
 
 
213 aa  317  8e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  70.33 
 
 
213 aa  317  8e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  70.33 
 
 
213 aa  317  8e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  70.81 
 
 
213 aa  317  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  70.81 
 
 
213 aa  317  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  70.81 
 
 
213 aa  317  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  70.81 
 
 
213 aa  317  9e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  70.81 
 
 
213 aa  317  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  70.81 
 
 
213 aa  317  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  70.81 
 
 
213 aa  317  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  70.81 
 
 
213 aa  317  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  70.81 
 
 
213 aa  317  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  70.33 
 
 
213 aa  316  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  70.33 
 
 
213 aa  313  9e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  70.33 
 
 
213 aa  313  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  70.33 
 
 
213 aa  313  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  70.05 
 
 
213 aa  312  2e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  69.23 
 
 
213 aa  312  3e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  69.71 
 
 
213 aa  310  7e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  68.42 
 
 
213 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  68.42 
 
 
213 aa  309  3e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  68.42 
 
 
213 aa  308  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0644  uridine kinase  67.62 
 
 
213 aa  280  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000687916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  55.98 
 
 
216 aa  249  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  55.02 
 
 
232 aa  248  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  55.02 
 
 
232 aa  247  8e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  53.37 
 
 
215 aa  235  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  53.37 
 
 
215 aa  235  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  52.94 
 
 
207 aa  231  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  51.69 
 
 
207 aa  224  5e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  50 
 
 
208 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  49.48 
 
 
208 aa  214  6e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  49.05 
 
 
211 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4500  uridine kinase  52.83 
 
 
212 aa  211  5e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0736  uridine kinase  52.83 
 
 
212 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  49.51 
 
 
209 aa  211  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4124  uridine kinase  52.83 
 
 
212 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  44.02 
 
 
219 aa  210  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  50.53 
 
 
207 aa  210  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4113  uridine kinase  52.83 
 
 
212 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4460  uridine kinase  52.83 
 
 
212 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0770159 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  51.06 
 
 
207 aa  209  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4227  uridine kinase  52.83 
 
 
212 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  51.06 
 
 
207 aa  209  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4513  uridine kinase  52.36 
 
 
212 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  2.95414e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4462  uridine kinase  52.36 
 
 
212 aa  208  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4276  uridine kinase  52.36 
 
 
212 aa  207  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4608  uridine kinase  52.36 
 
 
212 aa  207  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  45.15 
 
 
219 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3093  uridine kinase  51.42 
 
 
212 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  48.1 
 
 
218 aa  202  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.75656e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  48.57 
 
 
211 aa  201  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  44.55 
 
 
202 aa  200  1e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  44.5 
 
 
209 aa  198  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.94748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  45.37 
 
 
209 aa  192  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  45.5 
 
 
204 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  49.75 
 
 
242 aa  191  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  9.16272e-15 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  43 
 
 
213 aa  190  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  47.34 
 
 
206 aa  188  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  41.75 
 
 
214 aa  185  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  44.83 
 
 
209 aa  183  2e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  42.44 
 
 
202 aa  181  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2200  uridine kinase  48.28 
 
 
223 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  41.15 
 
 
210 aa  179  3e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0382  uridine kinase  47.34 
 
 
212 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0215949  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1238  uridine kinase  47.78 
 
 
211 aa  178  5e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  41.34 
 
 
204 aa  174  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0826  uridine kinase  49.71 
 
 
209 aa  173  2e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.362749  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  41.43 
 
 
208 aa  173  2e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.66982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  42.94 
 
 
201 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  40.59 
 
 
204 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.47377e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10398  predicted protein  44.21 
 
 
209 aa  166  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  43.28 
 
 
220 aa  166  3e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  43.52 
 
 
236 aa  162  2e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  41.83 
 
 
207 aa  157  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  36.36 
 
 
207 aa  157  1e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  38.35 
 
 
212 aa  153  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1557  uridine kinase  46.59 
 
 
231 aa  150  9e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>