More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1156 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  100 
 
 
369 aa  765    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  62.4 
 
 
364 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  57.89 
 
 
363 aa  454  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  45.18 
 
 
364 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  43.87 
 
 
365 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  45.98 
 
 
367 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  43.87 
 
 
365 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  43.05 
 
 
382 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  44.9 
 
 
364 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  42.74 
 
 
381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  42.15 
 
 
389 aa  279  7e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  41.27 
 
 
381 aa  278  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 
396 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  38.29 
 
 
373 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.82 
 
 
371 aa  262  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  36.19 
 
 
368 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  36.44 
 
 
429 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  39.28 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 
373 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2799  hypothetical protein  42.7 
 
 
194 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  43.66 
 
 
158 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 
188 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 
146 aa  99.4  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.422971  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
154 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  38.62 
 
 
154 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368211  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  84.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.86 
 
 
153 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  40.69 
 
 
164 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  41.18 
 
 
109 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.758103  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
178 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961517  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3165  hypothetical protein  23.67 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.94 
 
 
170 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0867  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.67 
 
 
144 aa  63.2  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0549  putative acetyltransferase  37.78 
 
 
141 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.97 
 
 
154 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0328  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.41 
 
 
189 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.87 
 
 
153 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
159 aa  60.8  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.08 
 
 
176 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2240  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
237 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.24 
 
 
148 aa  60.5  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.78 
 
 
163 aa  60.1  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.2 
 
 
162 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635704  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
170 aa  60.1  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.66 
 
 
860 aa  59.7  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2462  hypothetical protein  28.33 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4781  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 
266 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112634  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  32.8 
 
 
153 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  28.06 
 
 
145 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0187  acetyltransferase  33.81 
 
 
138 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.046026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  27.34 
 
 
145 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  37.04 
 
 
141 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  37.66 
 
 
141 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.29 
 
 
159 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  29.59 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.84 
 
 
153 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  29.59 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  29.59 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  35.8 
 
 
141 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2339  GCN5-like N-acetyltransferase  33.33 
 
 
200 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00797251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.19 
 
 
152 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
169 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3182  acetyltransferase  33.7 
 
 
142 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
152 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.52 
 
 
146 aa  53.9  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.99 
 
 
161 aa  53.9  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.469186  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  39.19 
 
 
160 aa  54.3  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1867  ribosomal protein (S18)-alanine acetyltransferase  30.82 
 
 
150 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.216572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  33.68 
 
 
146 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
139 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
161 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126445  normal  0.618144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.45 
 
 
149 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0227  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.23 
 
 
161 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  29.36 
 
 
146 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001601  acetyltransferase  30.65 
 
 
144 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  34.65 
 
 
891 aa  53.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  32.37 
 
 
158 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.78 
 
 
143 aa  53.1  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.240965  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
142 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2385  putative acetyltransferase  34.07 
 
 
151 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.110426  normal  0.478401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2169  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
150 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0666811  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1863  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.49 
 
 
150 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02800  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.44 
 
 
162 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4344  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
148 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.333923  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.17 
 
 
139 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1322  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.23 
 
 
161 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.86 
 
 
157 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3716  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.91 
 
 
151 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0086441  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0329  acetyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1777  acetyltransferase  27.03 
 
 
185 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  32.89 
 
 
141 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1296  GCN5-related N-acetyltransferase  49.09 
 
 
204 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>