27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0057 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  100 
 
 		 279 aa  579  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  45.21 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  39.22 
 
 		 635 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  30.54 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  33.58 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  28.21 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  30.57 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  31.18 
 
 		 560 aa  55.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  40.19 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  34.86 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  35.51 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  36.67 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  38.46 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  31.43 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  38.18 
 
 		 582 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  39.8 
 
 		 449 aa  47  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  33.33 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  34.29 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  34.29 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  34.29 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  34.29 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5951  CHAP domain-containing protein  40 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  38.27 
 
 		 468 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.47 
 
 		 655 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.94 
 
 		 619 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.94 
 
 		 619 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  30.17 
 
 		 390 aa  42.7  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>