41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3181 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  100 
 
 		 501 aa  999    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  46.73 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.73 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  37.5 
 
 		 504 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  32.93 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  30.66 
 
 		 496 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 		 497 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 424 aa  67  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  20.11 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  20.11 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  19.83 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  19.83 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  19.83 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  19.83 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  19.83 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  19.83 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  21.37 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  19.81 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  19.81 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  19.47 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  20.57 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 482 aa  53.9  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.59 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  17.77 
 
 		 488 aa  50.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 499 aa  47  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  25.16 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  18.52 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  31.48 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  18.23 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  18.23 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  18.06 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  18.23 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  17.66 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  25.1 
 
 		 488 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  19.12 
 
 		 511 aa  43.1  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 489 aa  43.5  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>