287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2091 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2091  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
180 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.616699  hitchhiker  3.51942e-22 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2146  ThiJ/PfpI domain-containing protein  99.44 
 
 
185 aa  363  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.21104e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1314  ThiJ/PfpI domain-containing protein  98.89 
 
 
185 aa  361  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.02067e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1190  ThiJ/PfpI domain protein  98.33 
 
 
185 aa  357  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00457983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2085  ThiJ/PfpI domain protein  97.78 
 
 
185 aa  357  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2477  ThiJ/PfpI domain-containing protein  78.33 
 
 
185 aa  299  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0083  ThiJ/PfpI domain protein  63.48 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4150  ThiJ/PfpI domain protein  62.78 
 
 
191 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4431  ThiJ/PfpI domain protein  62.78 
 
 
191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0065  ThiJ/PfpI domain protein  63.89 
 
 
191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0928  DJ-1/PfpI family protein  49.44 
 
 
192 aa  181  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.44 
 
 
192 aa  180  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3363  ThiJ/PfpI-family thiamine biogenesis protein  48.89 
 
 
192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  37.34 
 
 
184 aa  121  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  38.51 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  40.72 
 
 
184 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  36.31 
 
 
181 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  39.76 
 
 
202 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  37.16 
 
 
187 aa  97.4  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  35.56 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  34.34 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 
388 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  39.02 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  36.36 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  36.26 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  35.47 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  37.95 
 
 
182 aa  89  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  38.1 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  34.44 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3249  DJ-1 family protein  34.44 
 
 
196 aa  88.2  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3107  DJ-1 family protein  34.44 
 
 
196 aa  88.2  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  31.14 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  34.68 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  39.02 
 
 
184 aa  85.5  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  35.75 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  37.14 
 
 
184 aa  84.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  35.76 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0891  DJ-1 family protein  32.22 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915837  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  35.76 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  30.06 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  30.81 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2500  DJ-1 family protein  36.99 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0133891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  30.06 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  29.55 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  34.68 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  31.61 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  34.68 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  35.93 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  30.17 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  28.73 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  33.33 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  32.72 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  29.28 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  28.33 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  36.78 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  30.6 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1082  DJ-1 family protein  31.49 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  32.6 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3185  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3209  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000549408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00372  hypothetical protein  30.34 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0456  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  35.97 
 
 
261 aa  74.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00376  hypothetical protein  30.34 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0496  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0346  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0460  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0508  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44518  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  31.32 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  35.76 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03289  hypothetical protein  29.59 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  31.49 
 
 
196 aa  72  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  30.17 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  30.95 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  31.32 
 
 
196 aa  72  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  35.1 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0623  DJ-1 family protein  35.67 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.226753  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  37.5 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  31.52 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  34.44 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  39.02 
 
 
691 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002695  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis enzyme  29.52 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  39.02 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  28.99 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  39.02 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  39.02 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  39.02 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  30.59 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  39.02 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  39.02 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0472  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0474  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  30.38 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0535  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865123  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0493  DJ-1 family protein  30.34 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  33.14 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1895  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  27.37 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  30.39 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.39 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.39 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>