More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2533 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  100 
 
 		 610 aa  1243    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  91.8 
 
 		 608 aa  1158    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  91.8 
 
 		 608 aa  1158    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 		 608 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.3 
 
 		 609 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 611 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  47.33 
 
 		 613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 		 619 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  47.65 
 
 		 613 aa  559  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  47.1 
 
 		 613 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  47 
 
 		 613 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  47.16 
 
 		 613 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  47 
 
 		 613 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  46.84 
 
 		 613 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  46.84 
 
 		 613 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  46.94 
 
 		 613 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 621 aa  478  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 621 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 633 aa  347  3e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  42.62 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  43.26 
 
 		 449 aa  309  9e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 612 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 600 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 607 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 589 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 458 aa  250  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 590 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 594 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 571 aa  241  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 593 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 585 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 571 aa  238  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  28 
 
 		 581 aa  237  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 589 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  27.01 
 
 		 581 aa  234  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 597 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 597 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 581 aa  231  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 591 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 456 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 444 aa  226  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  31.35 
 
 		 587 aa  226  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  31.49 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  31.49 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  31.49 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 589 aa  226  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  31.4 
 
 		 587 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  31.49 
 
 		 587 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  31.24 
 
 		 587 aa  224  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  31.49 
 
 		 587 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 585 aa  223  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  31.26 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 604 aa  219  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  30.21 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  26.87 
 
 		 591 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 591 aa  213  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 583 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1579  histidine kinase  29.11 
 
 		 583 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 591 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 591 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  33.02 
 
 		 591 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  33.26 
 
 		 591 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  33.26 
 
 		 591 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  33.26 
 
 		 591 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  33.26 
 
 		 591 aa  211  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  33.26 
 
 		 591 aa  210  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  33.26 
 
 		 591 aa  210  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  30.77 
 
 		 589 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 582 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 592 aa  207  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 581 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  32.7 
 
 		 575 aa  205  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  32.95 
 
 		 571 aa  204  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 423 aa  204  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 587 aa  203  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 608 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  27.53 
 
 		 599 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  32.17 
 
 		 537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 418 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  32.73 
 
 		 571 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 584 aa  200  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  31.99 
 
 		 565 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  31.9 
 
 		 554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 597 aa  198  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 584 aa  198  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 590 aa  196  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  30.35 
 
 		 584 aa  195  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 606 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  30.04 
 
 		 762 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 584 aa  193  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 585 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 599 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>