More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1828 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  95.67 
 
 		 277 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  95.67 
 
 		 277 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  78.99 
 
 		 276 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  78.62 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  78.26 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  78.26 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  78.26 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  78.26 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  78.26 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  78.26 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  78.62 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  78.26 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  78.26 
 
 		 276 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  76.45 
 
 		 276 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  76.45 
 
 		 276 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  75.45 
 
 		 277 aa  432  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  75.45 
 
 		 277 aa  433  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  75.37 
 
 		 276 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  75 
 
 		 281 aa  422  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  71.84 
 
 		 277 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  72.04 
 
 		 279 aa  408  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  71.12 
 
 		 276 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  71.74 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  69.93 
 
 		 276 aa  400  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 278 aa  394  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 275 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  65.59 
 
 		 281 aa  390  1e-108  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  69.31 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  70.04 
 
 		 275 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  67.27 
 
 		 275 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  66.19 
 
 		 281 aa  384  1e-106  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 		 275 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  68.23 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  66.79 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  66.79 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  67.27 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  65.71 
 
 		 281 aa  380  1e-104  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  67.15 
 
 		 275 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  66.54 
 
 		 280 aa  374  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  68.23 
 
 		 281 aa  374  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  67.03 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  65.58 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  68.36 
 
 		 273 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  64.86 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  67.15 
 
 		 277 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  63.9 
 
 		 277 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 		 275 aa  360  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 275 aa  353  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 283 aa  351  5.9999999999999994e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0229  50S ribosomal protein L2  62.01 
 
 		 279 aa  349  2e-95  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.116801  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  62.37 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 275 aa  348  5e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 276 aa  345  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 276 aa  345  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 287 aa  346  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  65.38 
 
 		 274 aa  345  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  61.62 
 
 		 287 aa  345  5e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  62.73 
 
 		 287 aa  344  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 		 287 aa  338  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 279 aa  339  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 274 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 279 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3992  ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 287 aa  335  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 278 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  59.26 
 
 		 287 aa  335  5e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 274 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  59.21 
 
 		 274 aa  334  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  59.21 
 
 		 274 aa  334  7.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  59.21 
 
 		 274 aa  334  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 		 278 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 		 278 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 		 278 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 		 274 aa  333  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0317  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 275 aa  332  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000380441  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 287 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 287 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 275 aa  332  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585895  hitchhiker  0.0000000000261127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 273 aa  332  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0282  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 277 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161647  hitchhiker  0.00000193986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 		 273 aa  331  8e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0408  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 		 275 aa  331  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000019918  normal  0.14889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 273 aa  330  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3294  50S ribosomal protein L2  58.99 
 
 		 276 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000105073  hitchhiker  0.00000920299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 280 aa  331  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  62.95 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2947  50S ribosomal protein L2  58.63 
 
 		 276 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0126826  decreased coverage  0.00000017325 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0424  50S ribosomal protein L2  62.09 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0891588  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 		 287 aa  329  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>