More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0229 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0229  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.116801  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  65.23 
 
 		 281 aa  378  1e-104  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  61.29 
 
 		 281 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  63.44 
 
 		 277 aa  352  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  63.44 
 
 		 277 aa  352  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  61.51 
 
 		 281 aa  351  7e-96  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  62.01 
 
 		 277 aa  349  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  62.01 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  61.29 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  61.15 
 
 		 277 aa  341  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  60.79 
 
 		 277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  60.57 
 
 		 276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 276 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 276 aa  335  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 276 aa  335  7e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 276 aa  335  7e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 276 aa  335  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 276 aa  335  7e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 276 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  60.57 
 
 		 276 aa  334  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  60.57 
 
 		 276 aa  334  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  60.57 
 
 		 276 aa  334  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  58.63 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  58.63 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  58.42 
 
 		 275 aa  329  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  57.35 
 
 		 276 aa  328  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  59.86 
 
 		 277 aa  324  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  59.14 
 
 		 281 aa  322  5e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  59.35 
 
 		 276 aa  321  7e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  57.71 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 		 275 aa  315  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  57.71 
 
 		 278 aa  314  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  58.06 
 
 		 273 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 		 280 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  58.06 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  56.83 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  55.6 
 
 		 275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  55.91 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  57.55 
 
 		 275 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  54.68 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 		 274 aa  298  5e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  55.04 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  55.04 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  53.6 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  53.6 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  53.76 
 
 		 276 aa  295  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 287 aa  295  7e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  53.41 
 
 		 278 aa  294  9e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  53.41 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  55.76 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  54.84 
 
 		 275 aa  292  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  54.48 
 
 		 279 aa  289  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  52.36 
 
 		 287 aa  288  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  53.76 
 
 		 276 aa  288  7e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17371  50S ribosomal protein L2  52.36 
 
 		 287 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  51.97 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  51.97 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  55.4 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  52 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  55.16 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  54.68 
 
 		 277 aa  285  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  55.2 
 
 		 275 aa  285  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  54.15 
 
 		 275 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  54.84 
 
 		 273 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17621  50S ribosomal protein L2  52.01 
 
 		 287 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  54.84 
 
 		 273 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  49.46 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  54.32 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  54.32 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  51.97 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  49.1 
 
 		 287 aa  282  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  51.97 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  51.97 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  51.97 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  51.97 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  54.89 
 
 		 274 aa  281  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  51.61 
 
 		 275 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0317  50S ribosomal protein L2  53.24 
 
 		 275 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000380441  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  52.88 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585895  hitchhiker  0.0000000000261127 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  52.35 
 
 		 287 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  51.61 
 
 		 287 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  50.91 
 
 		 287 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 277 aa  278  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  53.24 
 
 		 274 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  53.45 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  54.87 
 
 		 272 aa  277  2e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  53.24 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  50.55 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 273 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0497  50S ribosomal protein L2  53.6 
 
 		 275 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000398645  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  53.41 
 
 		 275 aa  275  6e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>