More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2607 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  546  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  59.36 
 
 
294 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  28.57 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  28.1 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  28.1 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  28.1 
 
 
303 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  28.1 
 
 
303 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  28.1 
 
 
303 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  28.1 
 
 
303 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  28.1 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  28.1 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  27.74 
 
 
303 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  27.74 
 
 
303 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  28.99 
 
 
304 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 
305 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  28.57 
 
 
301 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  29.01 
 
 
301 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  29.01 
 
 
301 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  29.01 
 
 
301 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  28.63 
 
 
301 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  29.01 
 
 
301 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  28.63 
 
 
301 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  28.63 
 
 
301 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  29.01 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  29.39 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.54 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  29.39 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  31.46 
 
 
313 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 
283 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  34.88 
 
 
286 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.81 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  28.81 
 
 
302 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27.8 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27.8 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  28.47 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  27.93 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  27.46 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.12 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  30.41 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  26.22 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.14 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  29.77 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  32.14 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.9 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  26.07 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  26.8 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  29.77 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  30.21 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  30.6 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  29.96 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  30 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  30.71 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.46 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  31.75 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  33.46 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.3 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26.3 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  29.19 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  33.08 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  28.14 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  25.35 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  29.97 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.4 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  30.48 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.69 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.47 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  25.78 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.18 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.18 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  31.56 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  29.12 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  28.63 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  27.46 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  27.46 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  33.18 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  26.96 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>