More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2506 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2513  putative transposase  98.96 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  50.94 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  47.17 
 
 		 303 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  50.94 
 
 		 294 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  47.17 
 
 		 303 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  47.17 
 
 		 303 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  47.5 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  47.5 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  44.16 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  43.4 
 
 		 304 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  43.51 
 
 		 171 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  43.51 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  44.03 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.59 
 
 		 281 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.59 
 
 		 281 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  42.68 
 
 		 287 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.95 
 
 		 281 aa  111  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  46.04 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  46.04 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  45.32 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  45.32 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  45.32 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  45.32 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  45.32 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5459  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 		 365 aa  107  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00365854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.59 
 
 		 281 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  46.62 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  35.44 
 
 		 260 aa  101  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  36.71 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  52.73 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  45.19 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  51.82 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  44.27 
 
 		 145 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  37.18 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  37.18 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  41.35 
 
 		 256 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  35.03 
 
 		 253 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  35.03 
 
 		 253 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  43.48 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  43.48 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  35.03 
 
 		 253 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  35.03 
 
 		 253 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  35.03 
 
 		 253 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  35.9 
 
 		 255 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  35.9 
 
 		 255 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  35.44 
 
 		 266 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  33.76 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  33.76 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  33.76 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  41.96 
 
 		 146 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  34.62 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  35.26 
 
 		 210 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  35.26 
 
 		 210 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  46.61 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  33.12 
 
 		 176 aa  90.9  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  33.12 
 
 		 176 aa  90.9  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  33.76 
 
 		 252 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  33.76 
 
 		 252 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  33.76 
 
 		 252 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  33.76 
 
 		 252 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  33.76 
 
 		 252 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  33.76 
 
 		 252 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  35.26 
 
 		 210 aa  90.5  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  33.76 
 
 		 252 aa  90.5  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  33.76 
 
 		 252 aa  90.5  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.71 
 
 		 251 aa  90.5  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  33.97 
 
 		 260 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  33.97 
 
 		 260 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  33.33 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  33.33 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  33.33 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  33.33 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  33.33 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  36 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  33.97 
 
 		 260 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  33.97 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  33.97 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  33.97 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  33.97 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  33.97 
 
 		 260 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  43.7 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  34.67 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  32.48 
 
 		 149 aa  87.8  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0187  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0244  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0325  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  32.05 
 
 		 259 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  30.57 
 
 		 252 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  40.58 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  32.48 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  33.33 
 
 		 254 aa  84.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  33.33 
 
 		 254 aa  84.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  33.33 
 
 		 254 aa  84.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  33.33 
 
 		 254 aa  84.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  33.33 
 
 		 254 aa  84.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  33.33 
 
 		 254 aa  84.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>