More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1638 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 		 468 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  66.67 
 
 		 482 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 		 475 aa  637    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 		 482 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 		 468 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  68.67 
 
 		 471 aa  654    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 		 462 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 		 464 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 513 aa  1020    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 465 aa  636    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 		 465 aa  638    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.17 
 
 		 468 aa  632  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  65.7 
 
 		 487 aa  633  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.39 
 
 		 468 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  66.88 
 
 		 467 aa  628  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.39 
 
 		 482 aa  629  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 472 aa  628  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.09 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 		 470 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 		 470 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 		 469 aa  626  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.1 
 
 		 473 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 		 462 aa  625  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.58 
 
 		 475 aa  626  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.17 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 		 474 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.02 
 
 		 468 aa  621  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.02 
 
 		 468 aa  621  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.45 
 
 		 470 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.1 
 
 		 473 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 475 aa  624  1e-177  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 		 504 aa  622  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.96 
 
 		 470 aa  619  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 462 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.87 
 
 		 462 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 462 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.95 
 
 		 472 aa  620  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.18 
 
 		 484 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 462 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  64.81 
 
 		 476 aa  615  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.73 
 
 		 470 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.73 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.01 
 
 		 467 aa  616  1e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  66.16 
 
 		 470 aa  614  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.87 
 
 		 462 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.68 
 
 		 470 aa  611  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  64.24 
 
 		 482 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.68 
 
 		 470 aa  611  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.74 
 
 		 472 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 		 468 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.44 
 
 		 465 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4194  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 460 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.821346  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.58 
 
 		 458 aa  608  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 		 458 aa  608  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 		 467 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.06 
 
 		 481 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.68 
 
 		 482 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.87 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  64.76 
 
 		 485 aa  605  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.01 
 
 		 465 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 		 458 aa  606  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.75 
 
 		 476 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.87 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.58 
 
 		 459 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4075  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.999659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.07 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4257  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.28 
 
 		 460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.73 
 
 		 466 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.28 
 
 		 458 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 483 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.76 
 
 		 484 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4196  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.5 
 
 		 460 aa  604  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4146  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 483 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4090  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.32 
 
 		 475 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4255  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  65.24 
 
 		 465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  64.83 
 
 		 479 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.52 
 
 		 480 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.67 
 
 		 490 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3993  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 460 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  63.5 
 
 		 460 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.22 
 
 		 468 aa  599  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 470 aa  599  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.27 
 
 		 482 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4189  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.5 
 
 		 460 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.36 
 
 		 459 aa  599  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0022  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.66 
 
 		 466 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0274087  hitchhiker  0.000479158 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1531  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.11 
 
 		 486 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.96 
 
 		 474 aa  599  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03560  hypothetical protein  63.5 
 
 		 460 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>