165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0578 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0578  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1927  hypothetical protein  98.9 
 
 
272 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0322  hypothetical protein  88.1 
 
 
272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  66.42 
 
 
274 aa  315  5e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  48.72 
 
 
272 aa  234  9e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  39.78 
 
 
272 aa  181  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  39.57 
 
 
277 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  41.64 
 
 
276 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  41.91 
 
 
272 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  40.17 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  40.3 
 
 
274 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  43.48 
 
 
265 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01459  membrane protein  40.07 
 
 
273 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  39.27 
 
 
277 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  38.87 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  36.64 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  37.59 
 
 
274 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  37.21 
 
 
268 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  37.41 
 
 
298 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  34.75 
 
 
270 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  36.33 
 
 
267 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  37.17 
 
 
263 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  36.92 
 
 
260 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  35.46 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  37.17 
 
 
273 aa  139  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  37.74 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  37.35 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  36.43 
 
 
268 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  36.43 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  36.9 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  36.68 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  36.19 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  38.81 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  37.96 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  36.19 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  37.59 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  39.55 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  41.8 
 
 
273 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  36.4 
 
 
294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  33.47 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  37.66 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  38.96 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  38.28 
 
 
260 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  37.69 
 
 
265 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  30.15 
 
 
275 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  34.52 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  40.25 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  35.92 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  36.61 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  36.17 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  36.64 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  38.37 
 
 
265 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  37.76 
 
 
260 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  36.11 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  37.84 
 
 
241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  38.66 
 
 
274 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  34.04 
 
 
263 aa  115  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  34.85 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0366  hypothetical protein  35.9 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  33.91 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  36.33 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  38.82 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  37.31 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  37.45 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  40.98 
 
 
268 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  35.55 
 
 
264 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  35.37 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  35.63 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  33.98 
 
 
267 aa  109  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  33.05 
 
 
274 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  34.6 
 
 
262 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  35.06 
 
 
266 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  32.48 
 
 
266 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  35.22 
 
 
270 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  34.76 
 
 
268 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  36.76 
 
 
266 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  36.76 
 
 
266 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  34.42 
 
 
263 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  32.16 
 
 
268 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  35.71 
 
 
266 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  33.19 
 
 
264 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4249  hypothetical protein  38.91 
 
 
307 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  40.95 
 
 
263 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  36.11 
 
 
266 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  30.04 
 
 
270 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  36.11 
 
 
266 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  34.98 
 
 
268 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  34.4 
 
 
273 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  34.38 
 
 
270 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  34.25 
 
 
264 aa  102  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  36.76 
 
 
266 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0611  hypothetical protein  31.86 
 
 
294 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  36.04 
 
 
272 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  39.66 
 
 
263 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  35.74 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  32.43 
 
 
267 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  33.89 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  34.16 
 
 
268 aa  99  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  33.2 
 
 
264 aa  99  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  33.62 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>