29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0539 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  100 
 
 		 152 aa  306  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  78.95 
 
 		 152 aa  247  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  78.95 
 
 		 152 aa  247  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  58 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  49.33 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  47.65 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  42.86 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  35.53 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  34.67 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  34.21 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  35.14 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  32.5 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  34.21 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  39.01 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  33.76 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  33.12 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  32.7 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  36.49 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  31.97 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  32.37 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  34.19 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  31.65 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  33.33 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  32.82 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  30.19 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  32.09 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  52.83 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  32.12 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  31.54 
 
 		 169 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>