232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3755 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 182 aa  364  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  67.33 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  62.86 
 
 		 162 aa  178  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  58.57 
 
 		 172 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  58.5 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  64.79 
 
 		 148 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  60.45 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  59.7 
 
 		 155 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  59.7 
 
 		 155 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  63.12 
 
 		 140 aa  168  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  60.45 
 
 		 137 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  59.86 
 
 		 141 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  59.31 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  61.27 
 
 		 143 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  59.31 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  60.56 
 
 		 143 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  60.56 
 
 		 143 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  58.39 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  57.14 
 
 		 166 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  57.75 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  57.75 
 
 		 144 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  58.74 
 
 		 142 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  55.32 
 
 		 141 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  58.57 
 
 		 141 aa  154  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  57.86 
 
 		 141 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  58.27 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  57.55 
 
 		 141 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  58.27 
 
 		 141 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  55.4 
 
 		 141 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  56.74 
 
 		 143 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  57.86 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  55.4 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  53.19 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  57.04 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  46.48 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  51.3 
 
 		 144 aa  124  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  50 
 
 		 142 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3580  chaperone protein IbpA  45.95 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  47.3 
 
 		 158 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  43.66 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  51.15 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  49.26 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  45.6 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  48.32 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  49.59 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  49.59 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  49.59 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  49.59 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  49.59 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  49.59 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  49.59 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  49.59 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  47.97 
 
 		 148 aa  121  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  49.59 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  51.15 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  50 
 
 		 137 aa  120  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  48.92 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  47.48 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  49.59 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  48.12 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  48.46 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  49.59 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  49.59 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  48.85 
 
 		 139 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  48.85 
 
 		 139 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  48.85 
 
 		 139 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  48.39 
 
 		 145 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  48.85 
 
 		 139 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  48.85 
 
 		 137 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  45.58 
 
 		 153 aa  118  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  47.46 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  45.97 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4105  heat shock protein IbpA  49.24 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  46.97 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  47.54 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  49.62 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  46.97 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  41.78 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  44.12 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  46.72 
 
 		 145 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  47.69 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  50.41 
 
 		 137 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  47.69 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 		 156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  44.03 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  45.64 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0614  Hsp20/alpha crystallin family protein  46.56 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  43.31 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  45.97 
 
 		 147 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  45.97 
 
 		 147 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  46.4 
 
 		 147 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>