102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0961 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0961  protein of unknown function DUF559  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4529  hypothetical protein  68.97 
 
 		 117 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1522  hypothetical protein  43.08 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.576255  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1220  hypothetical protein  41.54 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1569  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0914412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1700  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.768881  normal  0.131278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1094  hypothetical protein  40.62 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.090836  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1238  protein of unknown function DUF559  41.22 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2356  hypothetical protein  41.53 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0831458  normal  0.14274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01266  hypothetical protein  38.94 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2357  protein of unknown function DUF559  38.94 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2336  hypothetical protein  38.94 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0813  protein of unknown function DUF559  40.74 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01277  hypothetical protein  38.94 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0163  hypothetical protein  38.6 
 
 		 194 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0541  hypothetical protein  40.57 
 
 		 225 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.164679  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1403  hypothetical protein  38.94 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860159  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1229  hypothetical protein  39.69 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7441  protein of unknown function DUF559  43.48 
 
 		 206 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0206411  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1037  protein of unknown function DUF559  42.72 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0701  hypothetical protein  39.42 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1496  hypothetical protein  38.05 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.668416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1525  hypothetical protein  39.81 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0683  hypothetical protein  39.42 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1188  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1774  hypothetical protein  44.23 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1037  hypothetical protein  45.65 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2348  hypothetical protein  43.81 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0037  protein of unknown function DUF559  37.39 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0966  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0562  hypothetical protein  43.27 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0046  hypothetical protein  40.54 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2722  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0433  hypothetical protein  39 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0546  hypothetical protein  38.39 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  0.680217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0405  hypothetical protein  41.58 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0647  hypothetical protein  43.27 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0213  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4935  protein of unknown function DUF559  41.07 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0533861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51690  hypothetical protein  43 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00189742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2097  hypothetical protein  42.57 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3456  hypothetical protein  41.12 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1559  hypothetical protein  39.64 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1572  hypothetical protein  35.34 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.62267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3209  protein of unknown function DUF559  35.92 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0254559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1869  hypothetical protein  41.35 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1553  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.672305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0673  hypothetical protein  40.38 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2808  hypothetical protein  46.25 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.446189  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1236  hypothetical protein  37.12 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.453512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3954  hypothetical protein  36.52 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal  0.657782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1681  protein of unknown function DUF559  40.21 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2952  hypothetical protein  41.35 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0003  hypothetical protein  37.38 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0029  hypothetical protein  40.45 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2534  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.984532  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  41.59 
 
 		 1279 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1578  hypothetical protein  40.38 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1959  hypothetical protein  42.53 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00461889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1651  hypothetical protein  43.02 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.173926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  37.27 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  37.27 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  0.00000422818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0550  DNA methyltransferase  36.21 
 
 		 1192 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0608509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1421 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3620  protein of unknown function DUF559  35.04 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5447  protein of unknown function DUF559  33.08 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1369  hypothetical protein  34.23 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.628827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0900  hypothetical protein  36.61 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.19 
 
 		 1403 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 1146 aa  71.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0011  protein of unknown function DUF559  36.79 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3609  hypothetical protein  34.23 
 
 		 201 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.239567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3362  hypothetical protein  54.55 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1674  protein of unknown function DUF559  40 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3525  hypothetical protein  35.64 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.739621  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0022  protein of unknown function DUF559  35.64 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  36.27 
 
 		 849 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3917  hypothetical protein  43.02 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0131192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0164  protein of unknown function DUF559  37 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0571  hypothetical protein  42.65 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210516  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2301  hypothetical protein  35.64 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  0.158552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2473  protein of unknown function DUF559  35.87 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0282  hypothetical protein  36 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  33.33 
 
 		 1712 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4118  hypothetical protein  30.69 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000578053  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0348  hypothetical protein  34.62 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3969  hypothetical protein  34.31 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897432  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3118  protein of unknown function DUF559  31 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.000000197105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0548  hypothetical protein  34.78 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.249593  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  36.99 
 
 		 925 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1938  hypothetical protein  42.59 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  33.33 
 
 		 1649 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  38.03 
 
 		 1697 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1724 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  32.65 
 
 		 1629 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1624  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.28 
 
 		 410 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2629  hypothetical protein  32.2 
 
 		 388 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  29.63 
 
 		 1410 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>