32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0015 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  100 
 
 		 166 aa  329  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  83.73 
 
 		 166 aa  282  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  77.11 
 
 		 166 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  70.48 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  64.86 
 
 		 148 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  42.41 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  41.77 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  40.72 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  38.96 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  32.54 
 
 		 171 aa  87.8  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  32.68 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  35.04 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  32.41 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  36.3 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  32.64 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  37.96 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  31.97 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  29.89 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  25.62 
 
 		 273 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  31.21 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0163  FixH family protein  31.87 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  29.87 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  29.46 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  35.05 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  42.03 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  32.14 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  25.66 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  24.19 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  24.19 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  27.12 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  26.76 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  26.67 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>