146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4336 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  78.89 
 
 
206 aa  318  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  56.04 
 
 
203 aa  213  1e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  53.48 
 
 
202 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  58.87 
 
 
203 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  57.45 
 
 
203 aa  168  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  55.32 
 
 
203 aa  163  2e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  56.03 
 
 
218 aa  162  5e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  55.32 
 
 
203 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  53.52 
 
 
207 aa  145  4e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  55.64 
 
 
207 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  43.8 
 
 
201 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  40.71 
 
 
201 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  42.15 
 
 
182 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  42.98 
 
 
183 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.87112e-10  decreased coverage  6.9205e-08 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  40.52 
 
 
187 aa  99.8  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.32173e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  38.06 
 
 
187 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  37.68 
 
 
188 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  40.62 
 
 
184 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  42.34 
 
 
197 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  38.84 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  40.88 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  38.69 
 
 
197 aa  84.3  1e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  41.61 
 
 
200 aa  84.3  1e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  35.95 
 
 
193 aa  83.6  2e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.63106e-07  unclonable  1.37407e-10 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  41.13 
 
 
182 aa  82.8  4e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  1.14136e-06 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
257 aa  82  7e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.12 
 
 
253 aa  81.3  1e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.09479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  40 
 
 
203 aa  79.7  3e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  36.81 
 
 
198 aa  79  6e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  39.26 
 
 
185 aa  77.8  1e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  34.25 
 
 
189 aa  77  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  33.78 
 
 
193 aa  75.1  8e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  37.69 
 
 
191 aa  75.1  9e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.56 
 
 
189 aa  74.7  1e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  32.43 
 
 
205 aa  74.3  1e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  31.85 
 
 
187 aa  73.6  2e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  33.12 
 
 
192 aa  73.6  3e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  31.16 
 
 
181 aa  72.8  5e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  36.67 
 
 
187 aa  71.6  1e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  31.91 
 
 
189 aa  70.5  2e-11  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  5.57218e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  32.62 
 
 
193 aa  70.5  2e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  31.41 
 
 
251 aa  70.5  2e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  31.69 
 
 
186 aa  70.1  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  29.66 
 
 
244 aa  70.1  3e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  37.5 
 
 
197 aa  69.3  5e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  33.83 
 
 
190 aa  68.9  6e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  33.82 
 
 
191 aa  68.9  6e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  31.25 
 
 
190 aa  68.9  7e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  33.55 
 
 
209 aa  68.6  8e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  29.93 
 
 
191 aa  68.2  9e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  34.87 
 
 
192 aa  68.6  9e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  29.37 
 
 
241 aa  67.8  1e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.58134e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  34.75 
 
 
199 aa  67.4  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.36885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
184 aa  67  2e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  35.92 
 
 
200 aa  67.4  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  38.41 
 
 
191 aa  66.6  3e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  33.11 
 
 
191 aa  66.2  4e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  28.67 
 
 
242 aa  65.5  7e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.23866e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  34.07 
 
 
200 aa  65.1  9e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  31.93 
 
 
202 aa  64.3  1e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  7.573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  29.45 
 
 
192 aa  63.5  2e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 
187 aa  62.8  4e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  29.59 
 
 
237 aa  61.6  1e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  31.82 
 
 
186 aa  61.2  1e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  33.87 
 
 
205 aa  60.1  3e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  30.2 
 
 
204 aa  60.1  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 
193 aa  60.1  3e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  30.86 
 
 
195 aa  60.1  3e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  32.88 
 
 
195 aa  60.1  3e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  34.53 
 
 
207 aa  59.3  4e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  35 
 
 
218 aa  59.7  4e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  34.31 
 
 
190 aa  59.3  5e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  32.2 
 
 
186 aa  58.9  6e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  31.54 
 
 
207 aa  58.5  7e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  28.26 
 
 
191 aa  57  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  33.1 
 
 
184 aa  57  2e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  31.71 
 
 
189 aa  56.6  3e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  39.19 
 
 
195 aa  56.2  4e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  30.5 
 
 
190 aa  56.2  4e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  29.45 
 
 
204 aa  55.8  5e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  30.72 
 
 
205 aa  55.5  7e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 
188 aa  55.5  8e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5110  protein of unknown function DUF820  40.32 
 
 
145 aa  55.1  9e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10814  normal  0.277047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  25.43 
 
 
245 aa  54.7  1e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  33.59 
 
 
203 aa  54.7  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  33.12 
 
 
205 aa  54.7  1e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  27.54 
 
 
191 aa  53.9  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  27.41 
 
 
188 aa  53.9  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  29.65 
 
 
194 aa  52.8  4e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  29.53 
 
 
205 aa  52.8  4e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  26.26 
 
 
214 aa  52.8  4e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  31.06 
 
 
219 aa  52  7e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  26.15 
 
 
182 aa  52  8e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  33 
 
 
188 aa  50.1  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  7.68463e-06  decreased coverage  7.90424e-07 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3259  protein of unknown function DUF820  29.68 
 
 
242 aa  49.7  4e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00168542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  25.36 
 
 
193 aa  49.7  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  33.6 
 
 
223 aa  49.3  5e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  30.36 
 
 
254 aa  48.9  6e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0693  protein of unknown function DUF820  30.36 
 
 
254 aa  48.9  7e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>