30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3974 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  100 
 
 		 263 aa  530  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  77.29 
 
 		 272 aa  370  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  45.24 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  39.92 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  31.17 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  30.3 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  27.97 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2913  LmbE family protein  27.97 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821813  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  31.09 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  30.47 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  32.16 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  32.93 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4392  hypothetical protein  30.51 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.45148  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  28.96 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  28.96 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  30.22 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2070  hypothetical protein  28.68 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  32.26 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  28.26 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  27.57 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6453  LmbE family protein  31.15 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1376  hypothetical protein  31.15 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3426  LmbE family protein  33.62 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00141665  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6045  LmbE family protein  29.51 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.048617  normal  0.182794 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  23.33 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5449  LmbE family protein  30.77 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  22.71 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  31.63 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  30.07 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  25.22 
 
 		 265 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>