122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3174 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3174  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 		 77 aa  151  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2901  exonuclease VII small subunit  85.53 
 
 		 80 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  57.14 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.37 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.27 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.61 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.19 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.23 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.23 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.1 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.98 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.54 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  50 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.38 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.3 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.21 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1663  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.26 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.26 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.29 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.28 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.26 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.26 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  44.26 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.26 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.26 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.26 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.43 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.29 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.26 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.34 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.54 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.81 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.21 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.57 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.3 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.81 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1766  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000846618  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1236  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.25 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.29 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.43 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.43 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.38 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.34 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.49 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.78 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.64 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.34 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.34 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 85 aa  43.5  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.66 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.93 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.34 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.85 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.62 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.48 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.38 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.74 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.21 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.33 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.48 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.92 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.7 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.92 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.29 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.29 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.74 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.22 
 
 		 86 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1133  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.68 
 
 		 90 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44078  hitchhiker  0.0045107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.92 
 
 		 86 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.99 
 
 		 85 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2035  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.8 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.62 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.23 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0941  Exonuclease VII small subunit  38.33 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>