More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2134 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  45.64 
 
 		 1015 aa  962    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  45 
 
 		 1015 aa  934    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  100 
 
 		 1024 aa  2108    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  90.23 
 
 		 1024 aa  1948    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 989 aa  205  4e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  23.59 
 
 		 1000 aa  195  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0980  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.75 
 
 		 440 aa  173  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  28.89 
 
 		 409 aa  171  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  29.21 
 
 		 415 aa  159  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0952  hypothetical protein  31.81 
 
 		 365 aa  156  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  26.48 
 
 		 678 aa  154  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  30.13 
 
 		 388 aa  152  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  27.02 
 
 		 688 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  28.2 
 
 		 386 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.7 
 
 		 385 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3062  FAD linked oxidase-like protein  33.54 
 
 		 387 aa  140  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  26.82 
 
 		 692 aa  140  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.29 
 
 		 383 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.95 
 
 		 683 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  29.28 
 
 		 703 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  29.28 
 
 		 703 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.79 
 
 		 383 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  29.28 
 
 		 703 aa  135  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  29.28 
 
 		 703 aa  136  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  29.28 
 
 		 703 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  29.28 
 
 		 703 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  28.4 
 
 		 629 aa  135  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  29.28 
 
 		 703 aa  136  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  29.28 
 
 		 703 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  29.28 
 
 		 703 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1774  hypothetical protein  30.65 
 
 		 356 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  28.65 
 
 		 390 aa  134  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  26.73 
 
 		 658 aa  132  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  27.47 
 
 		 703 aa  131  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.73 
 
 		 655 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.58 
 
 		 470 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.44 
 
 		 663 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.2 
 
 		 708 aa  129  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.3 
 
 		 712 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  27.53 
 
 		 375 aa  129  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.88 
 
 		 471 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.38 
 
 		 698 aa  128  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0771  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.81 
 
 		 406 aa  128  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0497692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.51 
 
 		 663 aa  127  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.95 
 
 		 470 aa  127  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.95 
 
 		 470 aa  127  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  25.86 
 
 		 483 aa  127  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.95 
 
 		 470 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.74 
 
 		 470 aa  126  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.66 
 
 		 699 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.74 
 
 		 470 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.74 
 
 		 470 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25 
 
 		 656 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  22.86 
 
 		 661 aa  126  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  25.85 
 
 		 459 aa  125  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.1 
 
 		 434 aa  125  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  24.74 
 
 		 470 aa  125  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.95 
 
 		 470 aa  125  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  24.74 
 
 		 470 aa  125  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.93 
 
 		 737 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.65 
 
 		 699 aa  124  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  25.71 
 
 		 678 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.27 
 
 		 470 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.67 
 
 		 694 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  25.06 
 
 		 699 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  25.18 
 
 		 423 aa  123  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  26.64 
 
 		 476 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  27.08 
 
 		 495 aa  122  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.28 
 
 		 717 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  23.81 
 
 		 659 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  24.87 
 
 		 655 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  23.64 
 
 		 716 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.02 
 
 		 475 aa  122  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.07 
 
 		 676 aa  121  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  25.89 
 
 		 727 aa  121  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.5 
 
 		 656 aa  120  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.58 
 
 		 664 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  29.16 
 
 		 387 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.27 
 
 		 686 aa  120  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  26.13 
 
 		 372 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.64 
 
 		 411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  26.07 
 
 		 671 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.76 
 
 		 722 aa  120  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1033 aa  119  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.58 
 
 		 664 aa  119  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.4 
 
 		 743 aa  119  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.18 
 
 		 469 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.48 
 
 		 469 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  26.21 
 
 		 471 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4016  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.65 
 
 		 265 aa  118  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  26.29 
 
 		 703 aa  118  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.18 
 
 		 469 aa  118  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  34.17 
 
 		 460 aa  118  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  26.62 
 
 		 730 aa  118  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  26.24 
 
 		 711 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  28.18 
 
 		 452 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.52 
 
 		 457 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3066  FAD linked oxidase-like protein  30.77 
 
 		 275 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.36 
 
 		 423 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.64 
 
 		 694 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>