36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0468 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0468  methyltransferase type 11  100 
 
 		 271 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0745455  unclonable  0.0000106435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 802 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  24.17 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.53 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  39.73 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.32 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 711 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 785 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1652  Methyltransferase type 11  23.2 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 710 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  40 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  28.1 
 
 		 1835 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  24.19 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.47 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  25.7 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.63 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  32.06 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  38.3 
 
 		 350 aa  42  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 257 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 457 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  23.13 
 
 		 211 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>