115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1652 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1652  Methyltransferase type 11  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  30 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  29.21 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2507  methyltransferase type 12  32.17 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4005  hypothetical protein  32.47 
 
 
250 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.151604  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  29.44 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
261 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
259 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
802 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  37.84 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0924  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.54 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 
226 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.19 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
353 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  32.04 
 
 
353 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2417  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  49.3  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.320398  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  25.34 
 
 
311 aa  48.9  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 
238 aa  48.9  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  28.75 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  34.26 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
996 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
711 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  26.82 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0468  methyltransferase type 11  23.2 
 
 
271 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0745455  unclonable  0.0000106435 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  30.34 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.52 
 
 
345 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
710 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
222 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.08 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.62 
 
 
252 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  26.35 
 
 
513 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 
240 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.61 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.86 
 
 
248 aa  45.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
753 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1106 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 
232 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  47.73 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  29.73 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.91 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.05 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  29.13 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.56 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.2 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.19 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  29.41 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  28 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  23.08 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  25.25 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.42 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  30.23 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1690  methyltransferase type 11  32.05 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.74 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  27.06 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  29.24 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.25 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.43 
 
 
230 aa  42.7  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
436 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0339  hypothetical protein  26.89 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0688998  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  32 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  32 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  32.28 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>