More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2255 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  100 
 
 
707 aa  1444  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  3.13892e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7102  elongation factor G  44.38 
 
 
710 aa  640  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  43.62 
 
 
719 aa  625  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  44.66 
 
 
691 aa  615  1e-174  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  43.66 
 
 
690 aa  593  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  43.62 
 
 
699 aa  592  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  42.25 
 
 
690 aa  591  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  4.80322e-05 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  41.87 
 
 
693 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  42.11 
 
 
691 aa  584  1e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  42.23 
 
 
691 aa  584  1e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  43.04 
 
 
696 aa  581  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  42.71 
 
 
691 aa  575  1e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  41.83 
 
 
695 aa  570  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.92 
 
 
692 aa  547  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  41.94 
 
 
680 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  39.92 
 
 
695 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  39.92 
 
 
694 aa  527  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.76436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  41.8 
 
 
696 aa  524  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  39.71 
 
 
679 aa  525  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  42.31 
 
 
701 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  43.02 
 
 
703 aa  521  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  42.17 
 
 
701 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  38 
 
 
682 aa  513  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.72853e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  38.52 
 
 
683 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  37.11 
 
 
696 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  39.94 
 
 
703 aa  506  1e-142  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  5.74662e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  36.75 
 
 
696 aa  506  1e-142  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  39.69 
 
 
673 aa  508  1e-142  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  38.18 
 
 
691 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.36 
 
 
667 aa  502  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  38.41 
 
 
686 aa  498  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  37.57 
 
 
670 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  37.38 
 
 
701 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  38.37 
 
 
692 aa  499  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.15728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  39.25 
 
 
701 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  38.12 
 
 
683 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  39.12 
 
 
691 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  9.20124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.52 
 
 
682 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  36.68 
 
 
694 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  36.95 
 
 
697 aa  494  1e-138  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  38.87 
 
 
692 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  36.83 
 
 
694 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  37.45 
 
 
688 aa  492  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  37.27 
 
 
673 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  37.61 
 
 
692 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  38.19 
 
 
689 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.11404e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  35.99 
 
 
697 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  38.32 
 
 
692 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.23332e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  39.32 
 
 
691 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  37.88 
 
 
689 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  37.84 
 
 
692 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.24117e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  38.68 
 
 
697 aa  488  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  37.96 
 
 
706 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  37.27 
 
 
692 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  37.84 
 
 
691 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  38.8 
 
 
691 aa  484  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  40.14 
 
 
690 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  36.7 
 
 
692 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  37.8 
 
 
694 aa  485  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  38.41 
 
 
689 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  38.9 
 
 
695 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  37.79 
 
 
691 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  36.7 
 
 
692 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  39.09 
 
 
697 aa  485  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  38.32 
 
 
692 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  38.26 
 
 
697 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  38.12 
 
 
697 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  36.98 
 
 
692 aa  482  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  37.24 
 
 
701 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  37.7 
 
 
691 aa  482  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  37.75 
 
 
693 aa  479  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  37.7 
 
 
691 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  38.53 
 
 
697 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  37.04 
 
 
697 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  37.55 
 
 
697 aa  482  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  2.18328e-05  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  37.84 
 
 
692 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  36.95 
 
 
701 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  38.63 
 
 
695 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  6.29985e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  38.41 
 
 
691 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  38.12 
 
 
697 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  37.91 
 
 
682 aa  478  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  37.04 
 
 
691 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  37.43 
 
 
691 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  38.48 
 
 
695 aa  476  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  37.55 
 
 
691 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  36.98 
 
 
692 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  5.56702e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  37.36 
 
 
692 aa  475  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.05392e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  38.05 
 
 
691 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  36.53 
 
 
695 aa  473  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  38.05 
 
 
691 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  37.13 
 
 
692 aa  475  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.39049e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  39.24 
 
 
690 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  37.94 
 
 
702 aa  475  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  38.77 
 
 
688 aa  474  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  4.05339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  37.7 
 
 
691 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  36.81 
 
 
701 aa  471  1e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  4.45234e-07 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  36.39 
 
 
692 aa  469  1e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  38.35 
 
 
693 aa  470  1e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  37.61 
 
 
691 aa  472  1e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  37.96 
 
 
697 aa  471  1e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>