More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1682 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  100 
 
 		 317 aa  643    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  35.94 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  35.43 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  35.94 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  35.87 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  34.49 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  35.86 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  35.51 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  33.69 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  33.69 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  35.03 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  37.5 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35.97 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  39.05 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  33.55 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  34.48 
 
 		 276 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  35.08 
 
 		 354 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.33 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  33.87 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  36.14 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  42.93 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  36.52 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  33.77 
 
 		 327 aa  148  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  35.42 
 
 		 312 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  33.69 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  36.77 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  39.78 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  33.88 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  36.43 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.99 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  38.28 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2836  hypothetical protein  35.89 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  42.05 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  40.91 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  33.69 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  35.29 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  35.29 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  35.29 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.13 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  34.18 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  34.18 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  33.54 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  37.5 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  30.46 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2605  patatin  35.89 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  40.34 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  38.97 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  34.09 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.99 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  45.45 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  32.79 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  38.97 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2443  patatin  35.31 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.66 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  38.97 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  34.82 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  34.52 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  34.52 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  34.52 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  32.38 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  34.52 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.98 
 
 		 253 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  32.67 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2513  patatin  35.31 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  36.92 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  31.83 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  38.46 
 
 		 263 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  38.46 
 
 		 263 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  38.46 
 
 		 263 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  38.46 
 
 		 263 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  37.95 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  35.61 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  37.38 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  47.92 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  40.5 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  34.14 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  43.78 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  30.82 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  30.63 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.9 
 
 		 275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  35.02 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  34.44 
 
 		 728 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  41.67 
 
 		 302 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.55 
 
 		 727 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  48.37 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  40.28 
 
 		 728 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  35.36 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  37.45 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  41.62 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  41.62 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  43.33 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  40.28 
 
 		 751 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  41.95 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  32.58 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  41.62 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  42.69 
 
 		 262 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  31.99 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  33 
 
 		 320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  34.98 
 
 		 352 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  36.1 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>