More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5379 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
252 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  84.96 
 
 
250 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5125  transcriptional regulator, GntR family  87.5 
 
 
243 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
228 aa  151  9e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 
245 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
251 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
263 aa  147  1e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
251 aa  147  2e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
251 aa  145  7e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
255 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 
233 aa  141  1e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  41.33 
 
 
233 aa  140  2e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  37.05 
 
 
249 aa  139  4e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  36.78 
 
 
233 aa  139  5e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
231 aa  138  8e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
231 aa  138  8e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
231 aa  138  8e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
231 aa  138  8e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
231 aa  138  8e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
231 aa  138  8e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
231 aa  138  8e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
246 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
254 aa  136  3e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
231 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6280  transcriptional regulator GntR family  38.97 
 
 
236 aa  134  1e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 
255 aa  134  1e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  35.83 
 
 
259 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3638  hypothetical protein  40.61 
 
 
230 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3280  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
230 aa  131  8e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  35 
 
 
259 aa  130  2e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 
250 aa  130  2e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 
236 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
248 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
244 aa  129  4e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 
236 aa  129  5e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 
246 aa  129  5e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
237 aa  129  7e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
237 aa  128  8e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3445  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
230 aa  127  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
221 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
238 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
235 aa  126  4e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
225 aa  125  4e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
234 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
245 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
268 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
234 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0727  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
232 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.475012 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
234 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  36.16 
 
 
235 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
234 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
255 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
234 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
234 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
221 aa  120  1e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 
249 aa  121  1e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5787  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
225 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00572916 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
234 aa  118  8e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 
224 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 
246 aa  118  1e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0914  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
249 aa  117  2e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4320  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
247 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196319  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 
246 aa  116  4e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
234 aa  116  4e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2469  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
256 aa  116  4e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
244 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
235 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
244 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
235 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0867  transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 
247 aa  115  7e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
236 aa  115  8e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0494  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
245 aa  114  1e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.708073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1118  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
225 aa  114  2e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.232597  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1038  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
225 aa  114  2e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3937  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 
251 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0563072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 
234 aa  112  8e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3530  transcriptional regulator GntR  34.36 
 
 
239 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  34.88 
 
 
250 aa  111  1e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 
252 aa  111  1e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1873  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 
231 aa  110  2e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561866  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
232 aa  110  2e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
259 aa  110  2e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  35.92 
 
 
229 aa  110  2e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 
233 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1096  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
277 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2253  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
222 aa  109  4e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218359  normal  0.132912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 
252 aa  109  4e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1884  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
222 aa  109  4e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0403  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
238 aa  109  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  1.48823e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3443  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
235 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 
260 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3485  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
222 aa  108  9e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122835  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
247 aa  108  9e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4418  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
236 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.494465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
252 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3189  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
268 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
247 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
253 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
249 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
229 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>