101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4206 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  768    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  39.94 
 
 		 376 aa  262  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  36.1 
 
 		 377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  36.1 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  35.83 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  35.83 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  35.2 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  30.05 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  33.82 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  37.18 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  32.5 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  26.89 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  37.98 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  34.31 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  38.02 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  33.09 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  36.29 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  29.53 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  36.97 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.98 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  40.35 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  29.44 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  38.6 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  33.77 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  24.58 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  33.14 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  31.4 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  25.4 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  27.31 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  28.22 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  23.79 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  36.52 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  31.79 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  35.34 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  35.4 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  33.88 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  33.59 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  35.4 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  35.4 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  37.93 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  35.96 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  32 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  31.54 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  33.63 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  32 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  33.62 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  30 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  37.04 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1404  saccharopine dehydrogenase  25.33 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  33.87 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  24.38 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  34.19 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  29.23 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  30.95 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  31.85 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  31.45 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  32.52 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  28.83 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  37.61 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  32.48 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  37.14 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  36.94 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  25.64 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  26.05 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  28.77 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.24 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  35.29 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  31.85 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  34.62 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  28.31 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  30 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  25.58 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  27.05 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  29.69 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  28.51 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  29.81 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  31.93 
 
 		 390 aa  52.8  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  30.16 
 
 		 414 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  28.36 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  28.36 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.36 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  26.42 
 
 		 554 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.03 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  31.2 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  27.64 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  26.56 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  24.5 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  24.83 
 
 		 1506 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  25.38 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  26.46 
 
 		 557 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  27.2 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  27.69 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  31.25 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  24.46 
 
 		 375 aa  46.2  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  26.36 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>