108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3068 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3068  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3223  hypothetical protein  80 
 
 		 165 aa  278  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5254  hypothetical protein  68.12 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4958  hypothetical protein  66.67 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5007  hypothetical protein  66.67 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.311792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4831  hypothetical protein  66.67 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0508  hypothetical protein  66.04 
 
 		 166 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07290  hypothetical protein  67.92 
 
 		 162 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.303168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0664  hypothetical protein  67.3 
 
 		 162 aa  226  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0789398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0466  hypothetical protein  65.64 
 
 		 163 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0510  hypothetical protein  64.81 
 
 		 174 aa  222  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05640  hypothetical protein  65.41 
 
 		 171 aa  221  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2641  protein of unknown function DUF45  63.98 
 
 		 167 aa  217  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1485  hypothetical protein  63.98 
 
 		 167 aa  216  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.991457  normal  0.699045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02954  predicted metal dependent hydrolase  64.52 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0616  protein of unknown function DUF45  64.52 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.903914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5013  hypothetical protein  63.52 
 
 		 174 aa  214  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3267  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3552  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0615  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3377  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3521  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4399  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.255986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02904  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3412  hypothetical protein  65.81 
 
 		 165 aa  213  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3482  hypothetical protein  65.81 
 
 		 165 aa  213  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3516  hypothetical protein  65.81 
 
 		 165 aa  213  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503461  hitchhiker  0.0000110103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3408  hypothetical protein  65.81 
 
 		 165 aa  213  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3578  hypothetical protein  65.81 
 
 		 165 aa  213  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01747  hypothetical protein  62.58 
 
 		 175 aa  210  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0180  hypothetical protein  59.75 
 
 		 169 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0498  hypothetical protein  63.23 
 
 		 169 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1097  hypothetical protein  63.23 
 
 		 169 aa  208  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0560  hypothetical protein  63.23 
 
 		 169 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3505  hypothetical protein  55.21 
 
 		 167 aa  208  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0250  hypothetical protein  57.23 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3643  protein of unknown function DUF45  54.6 
 
 		 167 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3541  hypothetical protein  60 
 
 		 166 aa  203  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1839  hypothetical protein  54.72 
 
 		 162 aa  202  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00369136  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4195  hypothetical protein  58.28 
 
 		 175 aa  201  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4315  hypothetical protein  60.38 
 
 		 170 aa  201  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3622  hypothetical protein  60.38 
 
 		 175 aa  200  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1608  hypothetical protein  54.09 
 
 		 162 aa  200  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000317368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3023  hypothetical protein  57.86 
 
 		 167 aa  200  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2949  protein of unknown function DUF45  60.65 
 
 		 166 aa  200  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0130  hypothetical protein  53.12 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0173602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1783  hypothetical protein  61.04 
 
 		 189 aa  197  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3055  hypothetical protein  59.35 
 
 		 169 aa  197  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0062  protein of unknown function DUF45  62.18 
 
 		 173 aa  197  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1408  protein of unknown function DUF45  60.9 
 
 		 177 aa  196  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0829  protein of unknown function DUF45  58.13 
 
 		 170 aa  194  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2775  hypothetical protein  56.44 
 
 		 207 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.828021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3432  protein of unknown function DUF45  57.5 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000422395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2840  hypothetical protein  51.52 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1535  hypothetical protein  55.13 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2608  hypothetical protein  51.85 
 
 		 169 aa  190  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.353391  hitchhiker  0.0000000267232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2446  hypothetical protein  51.85 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  hitchhiker  0.00000000481223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2516  hypothetical protein  51.85 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1039  hypothetical protein  59.24 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0188  hypothetical protein  54.14 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1271  hypothetical protein  57.79 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003680  hypothetical protein  48.75 
 
 		 171 aa  184  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1658  hypothetical protein  53.21 
 
 		 170 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1643  hypothetical protein  53.21 
 
 		 174 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00239821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1680  hypothetical protein  53.21 
 
 		 174 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0855822  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2700  protein of unknown function DUF45  53.21 
 
 		 174 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0148854  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1134  hypothetical protein  54.55 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02144  hypothetical protein  47.5 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1539  hypothetical protein  52.23 
 
 		 169 aa  181  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2454  hypothetical protein  51.53 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.542737  unclonable  0.00000219257 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1222  hypothetical protein  49.7 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2447  hypothetical protein  52.2 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2626  hypothetical protein  51.28 
 
 		 168 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2355  protein of unknown function DUF45  58.55 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1390  hypothetical protein  53.16 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2868  hypothetical protein  57.52 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1592  hypothetical protein  55.03 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.18877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3056  hypothetical protein  54.05 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  hitchhiker  0.00906067 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0136  hypothetical protein  47.17 
 
 		 163 aa  175  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1484  hypothetical protein  60.78 
 
 		 168 aa  173  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0142  putative metal-dependent hydrolase  52.45 
 
 		 153 aa  171  5.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2650  hypothetical protein  52.56 
 
 		 203 aa  169  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.473621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1213  protein of unknown function DUF45  49.06 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2061  hypothetical protein  50.67 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0980857  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3293  hypothetical protein  47.17 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1415  hypothetical protein  49.06 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00105973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02667  hypothetical protein  46.71 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.447659  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  34.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  30.41 
 
 		 254 aa  48.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  32.5 
 
 		 245 aa  47.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  27.54 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  27.78 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  32.98 
 
 		 243 aa  45.1  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  40.74 
 
 		 234 aa  44.7  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  32.86 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  45.71 
 
 		 251 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  38.64 
 
 		 201 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  27.69 
 
 		 249 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>