More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0625 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  100 
 
 
407 aa  817    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  80.99 
 
 
405 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  53.96 
 
 
404 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  50.37 
 
 
408 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  52.64 
 
 
396 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  51.5 
 
 
400 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  52.23 
 
 
405 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  53.42 
 
 
400 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  49.38 
 
 
397 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  52.37 
 
 
394 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  52.78 
 
 
391 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  52.15 
 
 
405 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  50.63 
 
 
392 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  51.5 
 
 
398 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  47.01 
 
 
403 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  53.42 
 
 
400 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  50 
 
 
382 aa  364  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  50.76 
 
 
393 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  52.41 
 
 
390 aa  359  6e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  50 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  49.49 
 
 
402 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  48.72 
 
 
393 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  49.49 
 
 
396 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  47.74 
 
 
392 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  47.63 
 
 
404 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  50.77 
 
 
400 aa  345  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  52.24 
 
 
402 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  47.25 
 
 
1305 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  48.51 
 
 
401 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  49.5 
 
 
398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  51.14 
 
 
392 aa  338  7e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  51.79 
 
 
389 aa  335  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  48.97 
 
 
1230 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  49.62 
 
 
399 aa  332  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  47.68 
 
 
394 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  47.88 
 
 
398 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  46.52 
 
 
402 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  48.76 
 
 
401 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  48.59 
 
 
390 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  49.87 
 
 
394 aa  328  9e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  46.27 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  52.49 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  52.49 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  48.97 
 
 
1228 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  48.45 
 
 
396 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.45 
 
 
396 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  48.87 
 
 
400 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  47.41 
 
 
392 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  47.13 
 
 
392 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  47.41 
 
 
392 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  48.51 
 
 
1230 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  47.16 
 
 
392 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  45.73 
 
 
397 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  45.88 
 
 
391 aa  316  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  44.5 
 
 
401 aa  316  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  47.16 
 
 
392 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  47.16 
 
 
392 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  47.16 
 
 
392 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  45.79 
 
 
395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  42.61 
 
 
372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  47.94 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  48.32 
 
 
389 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  45.02 
 
 
412 aa  310  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  47.79 
 
 
416 aa  309  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  42.68 
 
 
408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  44.99 
 
 
393 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  46.4 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  45.26 
 
 
397 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  47.37 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  46.12 
 
 
371 aa  301  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  42.61 
 
 
372 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  44.5 
 
 
401 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  47.67 
 
 
389 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  47.93 
 
 
399 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  44.25 
 
 
393 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  44.25 
 
 
393 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  42.75 
 
 
402 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  45.45 
 
 
371 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  40.72 
 
 
406 aa  292  7e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  44.17 
 
 
410 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  41.48 
 
 
394 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  45.97 
 
 
385 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  41.9 
 
 
403 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  39.61 
 
 
401 aa  286  4e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  40.58 
 
 
406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  38.73 
 
 
398 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  44.2 
 
 
391 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  46.15 
 
 
367 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  42.44 
 
 
392 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  41.65 
 
 
404 aa  276  5e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  43.45 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  39 
 
 
401 aa  273  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  40.74 
 
 
589 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  43.55 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  40.59 
 
 
405 aa  272  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  40.05 
 
 
395 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  40.39 
 
 
398 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  39.57 
 
 
403 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  39.57 
 
 
403 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  41.63 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>