More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1452 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  100 
 
 		 296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  94.59 
 
 		 296 aa  574  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  78.64 
 
 		 302 aa  475  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  63.29 
 
 		 299 aa  391  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  64.16 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.32 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.15 
 
 		 300 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  61.43 
 
 		 303 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  60.9 
 
 		 302 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  60.55 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  58.56 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  62.28 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.44 
 
 		 300 aa  363  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  59.03 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  59.86 
 
 		 302 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  61.51 
 
 		 300 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  58.16 
 
 		 301 aa  361  8e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  58.42 
 
 		 304 aa  361  9e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  59.17 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  58.9 
 
 		 303 aa  358  7e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.45 
 
 		 300 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  57.88 
 
 		 314 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  58.42 
 
 		 304 aa  351  7e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  58.36 
 
 		 314 aa  351  7e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  58.08 
 
 		 304 aa  351  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  57.73 
 
 		 304 aa  348  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  60.36 
 
 		 314 aa  345  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  58.87 
 
 		 300 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  56.04 
 
 		 295 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.37 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  55.44 
 
 		 296 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  55.56 
 
 		 301 aa  321  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  56.79 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  57.28 
 
 		 324 aa  318  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  53.74 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.76 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.76 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.54 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.8 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  53.74 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  57.35 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.63 
 
 		 304 aa  299  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  53.04 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.14 
 
 		 297 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  51.59 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  50.17 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  55.35 
 
 		 288 aa  292  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.15 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  53.99 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  55.71 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  52.07 
 
 		 297 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  50.49 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.68 
 
 		 308 aa  288  8e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  54.24 
 
 		 293 aa  288  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  49.35 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  49.31 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  49.66 
 
 		 334 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.36 
 
 		 323 aa  285  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.66 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  50.18 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  50.16 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  51.43 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  49.66 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  53.43 
 
 		 291 aa  282  6.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.48 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  51.03 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  48.95 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  50 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  49.65 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  50.72 
 
 		 292 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  51.41 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.45 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.74 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  49.18 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.81 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  52.87 
 
 		 280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.05 
 
 		 296 aa  268  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  49.65 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  47.7 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  50.36 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.7 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.65 
 
 		 295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  47.46 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.73 
 
 		 413 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  46.71 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  47.5 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  47.18 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  49.81 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.6 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  46.48 
 
 		 291 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  44.37 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  45.94 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  45.94 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  45.58 
 
 		 295 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2759  AAA ATPase central domain protein  45.45 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  47.04 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.91 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7758  ATPase  47.72 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>