26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0706 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  41 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  35.79 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  28.95 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  41.1 
 
 		 1294 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  41.54 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  30.23 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  40.79 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  41.46 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3062  DNA polymerase, beta-like region  31.96 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  31.31 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  38.54 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  44.26 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  37.76 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  32.05 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  46.51 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  43.06 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  32 
 
 		 191 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 103 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  41.86 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  27.38 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  35.59 
 
 		 103 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>