86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0376 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  100 
 
 		 130 aa  257  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  80.77 
 
 		 127 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  80.77 
 
 		 127 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  41.53 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.52 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  39.09 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  43.02 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  46.74 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  46.74 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  46.74 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  46.74 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  53.85 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  46.74 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  53.85 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  43.75 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.02 
 
 		 188 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.74 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  32.54 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  40 
 
 		 186 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  38.21 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  44.3 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  32.82 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  40.38 
 
 		 224 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.82 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  41.77 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  40.51 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  40.51 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  40.51 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  40.51 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  40.51 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  43.59 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  43.59 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  40.51 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  42.5 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  40.51 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  30.47 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  34.69 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  43.21 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  37.08 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4386  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.88 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.23 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0647  flagellar biosynthesis protein FliO  44.79 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.97 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  30.3 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  32.94 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  38.14 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1871  flagellar biosynthesis protein FliO  45.31 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.577074  normal  0.501189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  35.42 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2299  polar flagellar assembly protein FliO  28.09 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  30.85 
 
 		 144 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.59 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06194  flagellar protein  45.9 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00972  flagellar protein  45.9 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0238989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.25 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  30.77 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  42.68 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3798  flagellar biosynthesis protein, FliO  49.38 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1025  flagellar biosynthesis protein FliO  40.45 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3072  flagellar biosynthesis protein FliO  49.38 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.24 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  31.62 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.06 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  30.77 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  29.17 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4139  hypothetical protein  27.96 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00140577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1167  flagellar biosynthetic protein FliO  35.96 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481561  normal  0.0745006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  31.31 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  29.17 
 
 		 211 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2977  flagellar biosynthesis protein FliO  29 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.31 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.56 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2956  flagellar biosynthesis protein FliO  50 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4177  flagellar biosynthesis protein FliO  42.71 
 
 		 162 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  33.73 
 
 		 129 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  26.37 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.86 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  27.78 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  31.03 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  38.96 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.94 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1330  flagellar biosynthesis protein FliO  38.67 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1123  hypothetical protein  43.53 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1754  flagellar protein fliO  26.37 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  29.63 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  29.63 
 
 		 144 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>