213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2892 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  87.5 
 
 		 248 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  87.1 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  66.67 
 
 		 249 aa  339  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  65.79 
 
 		 252 aa  335  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  54.66 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  54.66 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  54.66 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  54.25 
 
 		 242 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  59.17 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  54.25 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  54.25 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  54.25 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  58.26 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  58.26 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  58.26 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  58.26 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  58.26 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  58.26 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  58.26 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  54.13 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  54.38 
 
 		 241 aa  258  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  51.58 
 
 		 241 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  44.72 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  46.09 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  48.44 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  47.39 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  44.54 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  46.7 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.54 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  46.19 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.33 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  45.11 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  45.75 
 
 		 246 aa  204  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.72 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.7 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  42.74 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  42.11 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  42.56 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.92 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.99 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  43.6 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  38.31 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  38.08 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  40.37 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  41 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  41.26 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  38.89 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  36.76 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  33.71 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  34.95 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  35.65 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  35.86 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.57 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.2 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  30.25 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  33.87 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.18 
 
 		 242 aa  115  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.04 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  32.02 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  31.14 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  30.96 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.64 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.78 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.78 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  35.18 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.82 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  31.22 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.83 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  28.21 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  33.99 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.2 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.06 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  30.08 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.16 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.99 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  29.38 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  27.13 
 
 		 235 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  29.03 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.34 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  28.42 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  27.89 
 
 		 262 aa  92  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  29.21 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.21 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.21 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.21 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.38 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.21 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  29.21 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  29.21 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.86 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.86 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.06 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.12 
 
 		 294 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.06 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.21 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  30.58 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.06 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.69 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.35 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>