More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2427 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  634  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  93.61 
 
 
313 aa  606  1e-172  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  93.61 
 
 
313 aa  606  1e-172  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  83.07 
 
 
313 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  81.47 
 
 
313 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 
313 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  74.12 
 
 
313 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 
313 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 
313 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 
313 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 
313 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  74.44 
 
 
313 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  74.12 
 
 
313 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  73.48 
 
 
313 aa  491  1e-138  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  73.48 
 
 
313 aa  491  1e-138  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  73.48 
 
 
313 aa  491  1e-138  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  73.48 
 
 
313 aa  491  1e-138  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  73.48 
 
 
313 aa  491  1e-138  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  73.48 
 
 
313 aa  491  1e-138  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  73.48 
 
 
313 aa  491  1e-138  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  73.16 
 
 
313 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  71.88 
 
 
313 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  71.57 
 
 
313 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  72.52 
 
 
313 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  55.91 
 
 
313 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2173  transcriptional regulator CysB-like protein  56.37 
 
 
314 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  56.15 
 
 
317 aa  371  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  57.78 
 
 
326 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2404  transcriptional regulator CysB-like protein  55.41 
 
 
314 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.044463  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4926  transcriptional regulator CysB-like protein  56.83 
 
 
313 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  58.17 
 
 
311 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1917  transcriptional regulator CysB-like protein  56.51 
 
 
313 aa  362  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1721  transcriptional regulator CysB-like protein  56.19 
 
 
313 aa  361  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  56.05 
 
 
321 aa  360  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  55.24 
 
 
313 aa  359  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  56.95 
 
 
308 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  56.17 
 
 
312 aa  357  1e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  56.44 
 
 
354 aa  357  1e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  54.93 
 
 
308 aa  356  2e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
308 aa  357  2e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
308 aa  356  2e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
308 aa  356  2e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
308 aa  356  2e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
308 aa  356  2e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
308 aa  356  2e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
308 aa  356  2e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
308 aa  356  2e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
308 aa  357  2e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  55.26 
 
 
308 aa  355  4e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  55.74 
 
 
308 aa  355  4e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  55.26 
 
 
308 aa  355  4e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  55.74 
 
 
308 aa  355  4e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
308 aa  355  6e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  55.74 
 
 
308 aa  355  7e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  54.93 
 
 
308 aa  354  9e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  55.59 
 
 
320 aa  352  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  55.59 
 
 
320 aa  352  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  54.28 
 
 
320 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  56.9 
 
 
308 aa  345  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
316 aa  343  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  53.92 
 
 
313 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2112  transcriptional regulator CysB-like protein  56.11 
 
 
317 aa  342  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  54.49 
 
 
306 aa  337  1e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  51.92 
 
 
312 aa  337  2e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  53.77 
 
 
315 aa  335  8e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  53.9 
 
 
311 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  1.24662e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  51.63 
 
 
309 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  51.96 
 
 
319 aa  332  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  52.13 
 
 
319 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
314 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  51.48 
 
 
327 aa  329  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  54.07 
 
 
314 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  51.35 
 
 
314 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.79611e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  48.56 
 
 
313 aa  322  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  49.34 
 
 
326 aa  319  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  52.79 
 
 
309 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 
308 aa  313  4e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 
333 aa  311  7e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  48.37 
 
 
323 aa  305  7e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  47.42 
 
 
324 aa  302  6e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  47.42 
 
 
324 aa  301  8e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  47.35 
 
 
324 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  47.35 
 
 
324 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  4.6762e-05 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  47.1 
 
 
324 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  47.35 
 
 
324 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  1.99307e-11 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  47.13 
 
 
335 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  46.23 
 
 
325 aa  299  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  45.9 
 
 
324 aa  298  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1662  transcriptional regulator CysB  45.9 
 
 
324 aa  298  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0319237  unclonable  1.81404e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  45.9 
 
 
324 aa  298  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  48.01 
 
 
324 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  8.91923e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  46.23 
 
 
324 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42013e-07 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  47.33 
 
 
324 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  47.02 
 
 
324 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  47.33 
 
 
324 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  45.57 
 
 
324 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  45.05 
 
 
324 aa  295  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  46.08 
 
 
325 aa  294  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1805  transcriptional regulator CysB  45.7 
 
 
324 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1324  transcriptional regulator CysB  45.9 
 
 
324 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>