More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1946 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
317 aa  647    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  77.07 
 
 
321 aa  514  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  75.08 
 
 
313 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 
313 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1721  transcriptional regulator CysB-like protein  75.71 
 
 
313 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1917  transcriptional regulator CysB-like protein  75.71 
 
 
313 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  75.39 
 
 
326 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2404  transcriptional regulator CysB-like protein  73.19 
 
 
314 aa  494  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.044463  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2173  transcriptional regulator CysB-like protein  73.19 
 
 
314 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4926  transcriptional regulator CysB-like protein  73.19 
 
 
313 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2112  transcriptional regulator CysB-like protein  75.08 
 
 
317 aa  481  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  58.36 
 
 
313 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  58.36 
 
 
313 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  58.04 
 
 
313 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  58.36 
 
 
313 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  57.37 
 
 
313 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  57.68 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  57.68 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  56.15 
 
 
313 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  56.43 
 
 
313 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  56.11 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  56.11 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  56.11 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  56.11 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  56.11 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  56.11 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  56.11 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  57.73 
 
 
313 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  55.21 
 
 
313 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  56.15 
 
 
313 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  55.94 
 
 
313 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  55.52 
 
 
313 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  54.69 
 
 
313 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  55 
 
 
313 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  52.05 
 
 
313 aa  351  7e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  53.23 
 
 
311 aa  326  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  50.32 
 
 
309 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  49.05 
 
 
324 aa  315  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  48.87 
 
 
324 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  49.68 
 
 
313 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  48.22 
 
 
324 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  48.22 
 
 
324 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  48.54 
 
 
324 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 
354 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  48.22 
 
 
324 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  48.22 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  47.25 
 
 
324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000142013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  49 
 
 
308 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  49 
 
 
308 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  47.25 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  0.0000000000199307 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  49 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  47.25 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  49 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  49 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  49 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  47.25 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  49 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  49 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  49 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  52.04 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  48.67 
 
 
308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  48.67 
 
 
308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  49.16 
 
 
308 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  48.67 
 
 
308 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  48.33 
 
 
308 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  48.33 
 
 
308 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  49.03 
 
 
323 aa  300  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  48.33 
 
 
308 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  48.33 
 
 
308 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  48 
 
 
308 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  48.54 
 
 
326 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  47.57 
 
 
312 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  46.6 
 
 
311 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  47.42 
 
 
306 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  46.13 
 
 
308 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
314 aa  292  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  45.45 
 
 
324 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  46.1 
 
 
325 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  45.45 
 
 
324 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1840  transcriptional regulator CysB  45.45 
 
 
324 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000484032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  44.66 
 
 
324 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2195  transcriptional regulator CysB  45.13 
 
 
324 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000422628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
308 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1615  transcriptional regulator CysB  45.45 
 
 
324 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000907367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  44.97 
 
 
335 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  44.81 
 
 
324 aa  288  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  45.13 
 
 
324 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  44.81 
 
 
324 aa  288  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  44.81 
 
 
324 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  44.81 
 
 
324 aa  288  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  44.81 
 
 
324 aa  288  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  44.81 
 
 
324 aa  288  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  44.81 
 
 
324 aa  288  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  44.81 
 
 
324 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  44.81 
 
 
324 aa  288  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  44.66 
 
 
324 aa  288  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  45.34 
 
 
319 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  46.58 
 
 
314 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  45.34 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>