150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1775 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 3165 aa  6225    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  32.62 
 
 		 3322 aa  961    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  42.87 
 
 		 3081 aa  1736    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  35.55 
 
 		 3301 aa  1150    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  44.64 
 
 		 2984 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  41.91 
 
 		 3004 aa  736    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.51 
 
 		 3028 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.11 
 
 		 3020 aa  1201    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.13 
 
 		 3079 aa  838    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.25 
 
 		 3128 aa  1999    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.43 
 
 		 2600 aa  541  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  45.21 
 
 		 3141 aa  536  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  45.32 
 
 		 3141 aa  536  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.78 
 
 		 2345 aa  522  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  34.26 
 
 		 1998 aa  486  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  56.48 
 
 		 1038 aa  487  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  34.9 
 
 		 3501 aa  451  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  34.62 
 
 		 3552 aa  440  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  33.33 
 
 		 3141 aa  433  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  33.56 
 
 		 3131 aa  423  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  34.11 
 
 		 3144 aa  423  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  31.51 
 
 		 3159 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  33.64 
 
 		 3147 aa  417  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.15 
 
 		 3884 aa  394  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.83 
 
 		 2782 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  34.18 
 
 		 3563 aa  386  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.6 
 
 		 3378 aa  385  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.45 
 
 		 3602 aa  380  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.64 
 
 		 3790 aa  376  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  32.4 
 
 		 3443 aa  376  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.25 
 
 		 3475 aa  377  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.04 
 
 		 3480 aa  370  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  31.69 
 
 		 5212 aa  368  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  30.48 
 
 		 2588 aa  366  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.63 
 
 		 2545 aa  365  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  30.47 
 
 		 2530 aa  364  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.64 
 
 		 3040 aa  362  9e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  31.61 
 
 		 2758 aa  361  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.28 
 
 		 3785 aa  350  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.32 
 
 		 3862 aa  341  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.97 
 
 		 3796 aa  339  5e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  31.6 
 
 		 3350 aa  332  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.26 
 
 		 3967 aa  322  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  38.03 
 
 		 812 aa  318  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.81 
 
 		 2421 aa  317  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  31.23 
 
 		 6274 aa  313  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.42 
 
 		 4966 aa  289  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  30.92 
 
 		 3300 aa  286  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.69 
 
 		 658 aa  283  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  38.24 
 
 		 710 aa  282  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  30.75 
 
 		 3526 aa  281  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  41.28 
 
 		 594 aa  260  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.32 
 
 		 1730 aa  257  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1268 aa  248  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.39 
 
 		 5981 aa  248  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.66 
 
 		 2670 aa  239  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.69 
 
 		 923 aa  226  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  33.11 
 
 		 2061 aa  216  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  32.55 
 
 		 1571 aa  214  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  34.42 
 
 		 1077 aa  214  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1052 aa  208  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  35.7 
 
 		 857 aa  207  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3272  hypothetical protein  35.99 
 
 		 763 aa  204  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  36.26 
 
 		 2827 aa  198  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.11 
 
 		 721 aa  197  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.86 
 
 		 1723 aa  192  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  28.65 
 
 		 1270 aa  188  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  26.04 
 
 		 2732 aa  181  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  24.53 
 
 		 2651 aa  180  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  29.6 
 
 		 2904 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  30.35 
 
 		 991 aa  175  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  25.43 
 
 		 2547 aa  169  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  28.47 
 
 		 2737 aa  163  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  35.73 
 
 		 541 aa  162  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.32 
 
 		 428 aa  155  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  24.53 
 
 		 2542 aa  153  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  32.47 
 
 		 2449 aa  150  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.68 
 
 		 2818 aa  148  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  30.17 
 
 		 2536 aa  147  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  30.31 
 
 		 3929 aa  147  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.08 
 
 		 2666 aa  147  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  34.71 
 
 		 1489 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  29.55 
 
 		 1841 aa  144  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0521  hypothetical protein  35.48 
 
 		 412 aa  142  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.718593  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.07 
 
 		 2786 aa  141  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  30.03 
 
 		 1719 aa  140  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.77 
 
 		 678 aa  140  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  33.41 
 
 		 915 aa  139  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  24.96 
 
 		 1745 aa  139  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  37.02 
 
 		 1651 aa  137  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  37.21 
 
 		 1618 aa  137  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.56 
 
 		 1508 aa  135  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.56 
 
 		 1508 aa  135  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  30.59 
 
 		 2350 aa  135  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.49 
 
 		 1508 aa  132  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.51 
 
 		 2847 aa  130  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  34.56 
 
 		 1635 aa  130  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.9 
 
 		 1508 aa  130  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  25.69 
 
 		 2964 aa  129  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  32.07 
 
 		 914 aa  128  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>