More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3142 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03939  acetate permease  62.57 
 
 		 549 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  62.57 
 
 		 549 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  63.46 
 
 		 551 aa  687    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  63.85 
 
 		 549 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  63.85 
 
 		 549 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  62.74 
 
 		 549 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  65.87 
 
 		 554 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35030  cation/acetate symporter ActP  66.97 
 
 		 552 aa  697    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.89065  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  62.57 
 
 		 554 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  62.52 
 
 		 552 aa  687    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  62.59 
 
 		 552 aa  671    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  63.62 
 
 		 552 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  85.42 
 
 		 577 aa  920    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  65.27 
 
 		 563 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  74.3 
 
 		 553 aa  818    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  78.96 
 
 		 575 aa  861    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  63.44 
 
 		 552 aa  695    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  70.42 
 
 		 559 aa  754    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  71.12 
 
 		 570 aa  765    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  71.3 
 
 		 574 aa  764    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  75.77 
 
 		 553 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  81.62 
 
 		 572 aa  898    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  66.06 
 
 		 554 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  65.69 
 
 		 552 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  58.72 
 
 		 577 aa  635    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  100 
 
 		 576 aa  1129    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  77.06 
 
 		 576 aa  841    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  68.11 
 
 		 563 aa  728    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  77.86 
 
 		 576 aa  843    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  69.29 
 
 		 574 aa  743    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  61.53 
 
 		 561 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.95 
 
 		 552 aa  638    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  65.27 
 
 		 563 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  62.06 
 
 		 561 aa  645    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  61.05 
 
 		 554 aa  650    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  64.12 
 
 		 559 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  62.21 
 
 		 549 aa  663    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  62.57 
 
 		 549 aa  681    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3782  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.14 
 
 		 563 aa  775    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804193  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  77.86 
 
 		 576 aa  843    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  64.63 
 
 		 563 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.21 
 
 		 560 aa  656    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  62.57 
 
 		 549 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  66.06 
 
 		 554 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  75.77 
 
 		 553 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  64.21 
 
 		 546 aa  648    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  63.85 
 
 		 549 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  63.72 
 
 		 550 aa  697    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  63.64 
 
 		 551 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  63.46 
 
 		 551 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  62.39 
 
 		 549 aa  679    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.53 
 
 		 561 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  62.74 
 
 		 549 aa  682    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  65.5 
 
 		 551 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  66.06 
 
 		 554 aa  702    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  63.85 
 
 		 549 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  65.5 
 
 		 551 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  61.64 
 
 		 520 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  80.28 
 
 		 571 aa  867    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  62.57 
 
 		 549 aa  680    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  63.24 
 
 		 553 aa  669    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  64.04 
 
 		 549 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  64.46 
 
 		 552 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03252  acetate permease  74.78 
 
 		 562 aa  791    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2501  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  73.19 
 
 		 607 aa  824    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000632414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  64.82 
 
 		 552 aa  698    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  62.74 
 
 		 549 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  99.31 
 
 		 576 aa  1123    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  75.35 
 
 		 577 aa  831    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  61.08 
 
 		 520 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  61.08 
 
 		 520 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  61.27 
 
 		 520 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  57.68 
 
 		 548 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25230  acetate permease  59.01 
 
 		 554 aa  613  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3743  acetate permease  60.37 
 
 		 554 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  59.27 
 
 		 666 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4010  acetate permease  56.7 
 
 		 557 aa  608  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.642464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  59.07 
 
 		 544 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3489  acetate permease  59.6 
 
 		 560 aa  601  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5644  Na+/solute symporter  58.29 
 
 		 545 aa  594  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439456  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  53.79 
 
 		 537 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  55.88 
 
 		 561 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35920  acetate permease  55.14 
 
 		 552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00568012  hitchhiker  5.12973e-17 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  55.88 
 
 		 561 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2797  acetate permease  54.63 
 
 		 552 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  55.48 
 
 		 564 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  55.88 
 
 		 561 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  55.46 
 
 		 561 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  55.57 
 
 		 561 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7091  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.5 
 
 		 557 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  56.04 
 
 		 554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3229  acetate permease  58.18 
 
 		 571 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0205  acetate permease  58.18 
 
 		 571 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1388  acetate permease  58.18 
 
 		 571 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2814  acetate permease  58.18 
 
 		 571 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0639  acetate permease  58.18 
 
 		 571 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352767  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0475  acetate permease  57.82 
 
 		 571 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00592631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  56.98 
 
 		 554 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0455  acetate permease  58.36 
 
 		 571 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3287  acetate permease  57.06 
 
 		 558 aa  557  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>