33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2868 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2591  hypothetical protein  70.21 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  72.34 
 
 		 93 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  63.16 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  57.45 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  57.14 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  54.35 
 
 		 91 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  39.76 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  44.62 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4143  protein of unknown function DUF1467  48.53 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666684  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  36.62 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  35.8 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2042  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  43.66 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  39.53 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  45.16 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  39.53 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  36.26 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1052  protein of unknown function DUF1467  59.52 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1039  hypothetical protein  37.1 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000558059  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  50 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1370  protein of unknown function DUF1467  37.68 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1278  protein of unknown function DUF1467  42.19 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231497  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  50 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  41.1 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  30.86 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1292  hypothetical protein  35.8 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0130  hypothetical protein  30.95 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3163  hypothetical protein  34.85 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.90075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2283  hypothetical protein  36.59 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0081  hypothetical protein  28.92 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>