39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2730 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2730  putative minor curlin subunit precursor (fimbrin sef17 minor subunit)  100 
 
 		 169 aa  334  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1274  hypothetical protein  43.83 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  34.59 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  34.74 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  37.89 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  31.29 
 
 		 500 aa  51.6  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  37.89 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  30.67 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  41.76 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  38.95 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  36.26 
 
 		 143 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  29.09 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  37.89 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  34.02 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  38.53 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  36.05 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  36.05 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  36.05 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  36.73 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  32.59 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  37.72 
 
 		 496 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  34.88 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  38.46 
 
 		 498 aa  44.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  36.08 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  37.86 
 
 		 496 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  36.25 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  37.5 
 
 		 502 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  38.46 
 
 		 502 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  37.5 
 
 		 502 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  35.09 
 
 		 503 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  36.89 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  27.34 
 
 		 483 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  28.95 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  36.73 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  39.77 
 
 		 496 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  39.77 
 
 		 496 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  39.77 
 
 		 496 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  28.19 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  35.4 
 
 		 451 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>