More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4915 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 310 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  83.17 
 
 		 328 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  82.52 
 
 		 316 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  82.08 
 
 		 309 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  82.3 
 
 		 308 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  80.39 
 
 		 308 aa  524  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  80.46 
 
 		 308 aa  517  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 		 309 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  68.51 
 
 		 314 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  67.65 
 
 		 314 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  66.67 
 
 		 317 aa  434  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  66.88 
 
 		 319 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  66.89 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  66.89 
 
 		 316 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  66.45 
 
 		 312 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  66.23 
 
 		 316 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  65.36 
 
 		 312 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  67.1 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  65.48 
 
 		 313 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  65.36 
 
 		 312 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  64.38 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  63.84 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  64.57 
 
 		 302 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  63.11 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  61.97 
 
 		 303 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  62.54 
 
 		 313 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  59.8 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 		 308 aa  360  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 		 308 aa  360  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  55.63 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  57.98 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  56.72 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 		 331 aa  352  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 		 308 aa  348  7e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  54.34 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  53.9 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 		 311 aa  315  5e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 304 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 307 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 303 aa  300  3e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 300 aa  298  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 		 309 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 309 aa  291  8e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 		 309 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 312 aa  288  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 309 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.23 
 
 		 306 aa  288  8e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 309 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 309 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 		 309 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 560 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 		 307 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 305 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 		 305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 307 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  46.13 
 
 		 316 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 		 311 aa  281  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  45.95 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  45.95 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  45.95 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>