36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0986 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 534 aa  1021    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  70.97 
 
 		 526 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  55.51 
 
 		 525 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  52.88 
 
 		 525 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  65.12 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  65.56 
 
 		 528 aa  207  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  46.23 
 
 		 542 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  44.14 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  41.78 
 
 		 495 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  37.89 
 
 		 526 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  53.06 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  42.86 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 641 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  42.86 
 
 		 463 aa  92  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  41.58 
 
 		 607 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1008  flagellar hook-length control protein  28.5 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345301  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3364  putative flagellar hook-length control protein  28.46 
 
 		 778 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  31.78 
 
 		 686 aa  51.6  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1634  flagellar hook-length control protein  34 
 
 		 531 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0344613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  31.71 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  27.34 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  32.29 
 
 		 674 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1259  flagellar hook-length control protein  29.47 
 
 		 619 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2977  hypothetical protein  29.23 
 
 		 528 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618788  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0248  flagellar hook-length control protein  31.73 
 
 		 631 aa  47  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0205536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2719  flagellar hook-length control protein  28.91 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.243255  normal  0.82206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  27.07 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  30.67 
 
 		 552 aa  45.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  32.26 
 
 		 491 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1705  flagellar hook-length control protein  28.44 
 
 		 375 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  27.81 
 
 		 495 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1713  hypothetical protein  30.69 
 
 		 592 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1699  flagellar hook-length control protein  28.44 
 
 		 375 aa  43.5  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0151155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0847  flagellar hook-length control protein  34.48 
 
 		 504 aa  43.9  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1047  motD-related protein  32.8 
 
 		 420 aa  43.5  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1241  flagellar hook-length control protein  28.44 
 
 		 375 aa  43.5  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.896281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>