More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0588 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  96.45 
 
 		 143 aa  280  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  92.25 
 
 		 143 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  93.53 
 
 		 151 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  87.76 
 
 		 150 aa  263  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  86.58 
 
 		 149 aa  263  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  81.17 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  70.83 
 
 		 144 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  68.38 
 
 		 140 aa  200  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  67.61 
 
 		 168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  68.94 
 
 		 135 aa  191  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  70.77 
 
 		 139 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  70.68 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  69.34 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  68.66 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  62.77 
 
 		 140 aa  180  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  68.46 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  66.67 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  59.85 
 
 		 141 aa  171  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  63.08 
 
 		 137 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  62.31 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  62.31 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  63.08 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  61.54 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  57.72 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  51.85 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  50.38 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  49.64 
 
 		 142 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  53.28 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  48 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  52.46 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  50.74 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  46.92 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  49.22 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  46.22 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  46.22 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  46.67 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  46.22 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  45.38 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  45.38 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  44.54 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  44.54 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  44.54 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  42.06 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  42.62 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  42.86 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  42.86 
 
 		 143 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  42.86 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  40.98 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  39.1 
 
 		 139 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  43.7 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  45.16 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  42.14 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  42.98 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  39.84 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  41.27 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  41.55 
 
 		 146 aa  97.8  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  40.8 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  40.48 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  40.98 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  43.44 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 		 144 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  41.18 
 
 		 143 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  41.18 
 
 		 143 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  39.68 
 
 		 143 aa  95.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  41.18 
 
 		 143 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  39.68 
 
 		 143 aa  94.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 		 148 aa  94.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  41.18 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  40.34 
 
 		 149 aa  94.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  43.33 
 
 		 167 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  39.68 
 
 		 143 aa  94.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  43.44 
 
 		 147 aa  94.4  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  43.33 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  43.33 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  39.67 
 
 		 135 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  41.8 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  39.2 
 
 		 143 aa  94  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  39.2 
 
 		 143 aa  94  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  39.2 
 
 		 143 aa  94  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  39.2 
 
 		 143 aa  94  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  39.67 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  38.89 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  39.02 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  40.16 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  40.34 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  40.34 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  40.98 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>