More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0274 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.16 
 
 
468 aa  644  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.06 
 
 
471 aa  658  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.58 
 
 
480 aa  835  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.17 
 
 
468 aa  660  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  94.86 
 
 
467 aa  892  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.03 
 
 
467 aa  671  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.45 
 
 
467 aa  660  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.51 
 
 
467 aa  827  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.51 
 
 
467 aa  827  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.87 
 
 
467 aa  845  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.75 
 
 
469 aa  660  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
467 aa  932  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.1 
 
 
467 aa  676  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  92.72 
 
 
467 aa  877  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.74 
 
 
470 aa  636  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.75 
 
 
466 aa  650  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.67 
 
 
467 aa  686  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.46 
 
 
467 aa  684  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.88 
 
 
467 aa  663  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.9 
 
 
467 aa  759  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.38 
 
 
468 aa  643  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.18 
 
 
466 aa  667  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.1 
 
 
468 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.72 
 
 
470 aa  630  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.96 
 
 
463 aa  624  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.31 
 
 
581 aa  622  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.67 
 
 
468 aa  623  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.29 
 
 
466 aa  589  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.6 
 
 
466 aa  572  1e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.76 
 
 
466 aa  571  1e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.8 
 
 
462 aa  561  1e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.54 
 
 
466 aa  562  1e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.32 
 
 
464 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.43 
 
 
463 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.09 
 
 
462 aa  557  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.37 
 
 
462 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.94 
 
 
462 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.48 
 
 
468 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.3 
 
 
466 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.49 
 
 
465 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  60.47 
 
 
464 aa  540  1e-152  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.47 
 
 
466 aa  541  1e-152  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.62 
 
 
466 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.01 
 
 
463 aa  535  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.97 
 
 
466 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.97 
 
 
466 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.69 
 
 
465 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.62 
 
 
462 aa  516  1e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  54.39 
 
 
500 aa  516  1e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.5 
 
 
462 aa  513  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  57.42 
 
 
511 aa  508  1e-142  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.82 
 
 
467 aa  506  1e-142  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.05 
 
 
466 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.06 
 
 
468 aa  493  1e-138  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.06 
 
 
467 aa  488  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  54.08 
 
 
466 aa  491  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.04 
 
 
481 aa  485  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.54 
 
 
466 aa  478  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.19 
 
 
479 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  55.6 
 
 
504 aa  480  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.94 
 
 
467 aa  478  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.69 
 
 
474 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  51.28 
 
 
468 aa  475  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.49 
 
 
459 aa  472  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.46 
 
 
460 aa  469  1e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0509  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.97 
 
 
463 aa  471  1e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.317708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.23 
 
 
477 aa  467  1e-130  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 
475 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
476 aa  458  1e-128  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
476 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
476 aa  458  1e-128  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.63 
 
 
470 aa  459  1e-128  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.84 
 
 
476 aa  460  1e-128  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
476 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.04 
 
 
476 aa  461  1e-128  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 
476 aa  460  1e-128  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
476 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
476 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.5 
 
 
470 aa  458  1e-128  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.63 
 
 
476 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
476 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.13 
 
 
478 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.13 
 
 
478 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.07 
 
 
471 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 
478 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.06 
 
 
474 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.74 
 
 
477 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
478 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
476 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
476 aa  454  1e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
476 aa  454  1e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 
478 aa  453  1e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
476 aa  454  1e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
476 aa  454  1e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
476 aa  454  1e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 
476 aa  453  1e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 
476 aa  452  1e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 
480 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.48 
 
 
474 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.94 
 
 
474 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>