More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4330 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4330  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  603  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4781  hypothetical protein  84.69 
 
 
337 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2239  esterase/lipase/thioesterase  67.24 
 
 
322 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5823  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.11 
 
 
320 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3349  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.94 
 
 
316 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3477  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.13 
 
 
316 aa  169  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3153  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.13 
 
 
316 aa  168  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.566482  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0540  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.34 
 
 
318 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0472  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.27 
 
 
322 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3261  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
316 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1452  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4532  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.6 
 
 
316 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.472069  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6392  hypothetical protein  35.59 
 
 
220 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.22 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.41 
 
 
313 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.22 
 
 
311 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.02 
 
 
325 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.56 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.41 
 
 
229 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149419  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.61 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.3 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.29 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.58 
 
 
310 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  31.94 
 
 
319 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.68 
 
 
310 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  31.03 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.94 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1415  heroin esterase  30.2 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0841271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.08 
 
 
382 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.65 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.04 
 
 
315 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.52 
 
 
320 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0567  acetyl esterase  26.32 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3140  acetyl esterase  26.72 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.848607  hitchhiker  0.00168444 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.98 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.06 
 
 
310 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1001  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30 
 
 
311 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.35 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.02 
 
 
324 aa  92  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0553  acetyl esterase  26.72 
 
 
319 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00427  acetyl esterase  26.72 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3134  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.32 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.999028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.45 
 
 
314 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  31.52 
 
 
346 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0519  acetyl esterase  26.32 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00432  hypothetical protein  26.72 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06580  esterase/lipase  32.96 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  32.93 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.15 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04980  esterase/lipase  29.12 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.33 
 
 
311 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0407  acetyl esterase  26.72 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.23 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.08 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.56 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  30.55 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0514  acetyl esterase  27.51 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.13 
 
 
347 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.68 
 
 
310 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.68 
 
 
310 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  31.45 
 
 
311 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08242  lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03770)  32.68 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal  0.153385 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.92 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.22 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4350  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.66 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00963148  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4715  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.98 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6232  esterase/lipase/thioesterase  30.91 
 
 
329 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4466  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.68 
 
 
320 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0552  acetyl esterase  24.62 
 
 
323 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.55 
 
 
311 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2733  carboxylesterase  30.13 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0800200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  30.34 
 
 
444 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.88 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.21 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2140  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.3 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0536  acetyl esterase  24.62 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0537  acetyl esterase  25 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2458  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.15 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  32.64 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0542  acetyl esterase  24.62 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.2 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05501  lipase/esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01050)  32.08 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.737319  normal  0.319668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.64 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  31.03 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.8 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  32.33 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.08 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.11 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.59 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.34 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3484  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.28 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.47 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  31.86 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.03 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.57 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2298  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.74 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.2 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.86 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.19 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  30.81 
 
 
884 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>