More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3344 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  607  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  90.2 
 
 		 314 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  71.22 
 
 		 314 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  68.36 
 
 		 294 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  68.13 
 
 		 294 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  63.81 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  39.29 
 
 		 324 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  42.91 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  40.78 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  41.39 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  39.2 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  36.07 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  36.52 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  39.15 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  35.46 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  43.42 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  36.9 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  34.78 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  36.08 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  36.08 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  35.1 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  35.74 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  38.66 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  36.97 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  34.82 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  42.49 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  29.93 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  31.85 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  36.06 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  33.04 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  28.52 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  33.99 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  35.79 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  35.79 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  35.79 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  32.76 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  32.58 
 
 		 271 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  32.35 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  29.73 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  32.19 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  34.62 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  29.6 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  28.99 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  28.99 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  28.99 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  28.5 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  28.5 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  28.99 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  28.99 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  28.99 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  28.99 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  30.4 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  30.42 
 
 		 315 aa  99.4  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  31.33 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  31.33 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  31.33 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  28.41 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  28.44 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.72 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  29.15 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  28.42 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  29.2 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  33.17 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  30.31 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  28.47 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  29.6 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  29.88 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4186  putative alpha/beta superfamily hydrolase  27.5 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0367374  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  28.38 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  31.97 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  30.96 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  28.47 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  30.92 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  28.3 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.24 
 
 		 286 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  31.86 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  28.88 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.46 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  30.17 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.12 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  28.83 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.3 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2084  alpha/beta fold family hydrolase N  28.45 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.96 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.19 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  29 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  29.95 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  30.64 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  31.52 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0187  hypothetical protein  26.79 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  21.77 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  29.85 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2845  temperature sensitive supressor-like  30.28 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  26.1 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21275  predicted protein  31.69 
 
 		 239 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  25.59 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>