More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0016 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  100 
 
 		 98 aa  199  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  100 
 
 		 98 aa  199  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0630  transposase IS3/IS911  86.73 
 
 		 98 aa  176  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  83.67 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  83.67 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  83.67 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0644  IS3/IS911 family transposase OrfA  86.32 
 
 		 99 aa  168  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255096  normal  0.377263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 99 aa  149  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0539  IS3/IS911 family transposase OrfA  85 
 
 		 91 aa  141  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1119  transposase IS3/IS911 family protein  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1025  transposase IS3/IS911 family protein  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0730  transposase IS3/IS911 family protein  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0706575  decreased coverage  0.000000321811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1314  transposase IS3/IS911 family protein  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1052  transposase IS3/IS911 family protein  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1357  transposase IS3/IS911 family protein  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1477  transposase IS3/IS911 family protein  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.21104  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1355  transposase IS3/IS911 family protein  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1027  transposase IS3/IS911 family protein  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0925  IS3/IS911 family transposase OrfA  81.97 
 
 		 61 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0651  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0462736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1128  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1988  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.275987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1992  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.203185  normal  0.714899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  44 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  43.01 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  43.01 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  41.84 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  41.84 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  40.66 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  40.62 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.82 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  40.82 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1963  transposase IS3/IS911 family protein  47.42 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0174  transposase IS3/IS911 family protein  47.42 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3923  transposase IS3/IS911 family protein  47.42 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1466  transposase IS3/IS911 family protein  47.42 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  38.46 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  39.8 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  42.39 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  42.39 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  42.39 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  42.39 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  42.39 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  42.39 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  42.39 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  39.8 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  39.33 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  39.33 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  39.18 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  39.18 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  39.18 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  39.18 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  39.18 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  33.66 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  38.61 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  40.86 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  40.86 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  38.3 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  37.36 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  37.36 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  37.36 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>