More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3862 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  96.46 
 
 		 395 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  92.62 
 
 		 397 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  97.22 
 
 		 395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  57.4 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  57.4 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  57.4 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  59.33 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  59.33 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  59.07 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  59.33 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  58.84 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  60.88 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  59.33 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  65.28 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  56.59 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  56.33 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  59.59 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  58.23 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  58.23 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  58.23 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  58.23 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  56.91 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  57.97 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  56.4 
 
 		 399 aa  356  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  62.66 
 
 		 329 aa  336  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  48.38 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 426 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  45.09 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  57.88 
 
 		 293 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  45.23 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  42.56 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  44.94 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  50.63 
 
 		 402 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  45.41 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 402 aa  255  8e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  47.93 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 399 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  49.34 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  42.56 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  42.71 
 
 		 405 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  42.71 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  42.45 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  42.45 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  42.45 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  42.45 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  42.45 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 416 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 		 405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3576  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 		 401 aa  233  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.0569566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 398 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  38.38 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  38.38 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  42.23 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  42.23 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  42.23 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  42.23 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  42.23 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  42.35 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  42.23 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  42.34 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 411 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>