171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3087 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  92.17 
 
 		 166 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  91.57 
 
 		 166 aa  300  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  65.66 
 
 		 185 aa  224  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  65.66 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  65.66 
 
 		 168 aa  223  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  65.66 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  65.66 
 
 		 190 aa  222  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  65.06 
 
 		 168 aa  222  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  65.66 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  65.06 
 
 		 168 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  65.66 
 
 		 168 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  65.66 
 
 		 168 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  65.66 
 
 		 214 aa  221  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3218  redoxin domain-containing protein  62.87 
 
 		 167 aa  220  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0848811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.46 
 
 		 168 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  63.86 
 
 		 168 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  63.86 
 
 		 168 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  63.86 
 
 		 168 aa  217  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  63.86 
 
 		 169 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  63.86 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  63.86 
 
 		 167 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.28 
 
 		 168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  57.23 
 
 		 166 aa  205  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  60.24 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  59.04 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  60.12 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  56.63 
 
 		 166 aa  201  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.29 
 
 		 168 aa  200  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  59.04 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  54.88 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.27 
 
 		 183 aa  188  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.88 
 
 		 168 aa  187  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  54.49 
 
 		 168 aa  187  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  53.29 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  52.76 
 
 		 185 aa  183  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  52.15 
 
 		 168 aa  181  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  52.76 
 
 		 192 aa  181  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  51.22 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.61 
 
 		 167 aa  173  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0042  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50.6 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.83 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  49.7 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  50.28 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  48.17 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  51.52 
 
 		 162 aa  157  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0501  Redoxin domain protein  46.67 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3057  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.27 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.52 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  49.09 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  50.3 
 
 		 157 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  48.48 
 
 		 157 aa  148  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  47.56 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  50.91 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  50.91 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  50.91 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  49.09 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.09 
 
 		 157 aa  147  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  49.7 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  44.51 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  49.7 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  50.3 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  50.3 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  45.45 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  49.09 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  49.09 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  49.09 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.73 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  48.48 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17484  predicted protein  51.54 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  47.88 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  45.73 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  55.12 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  53.54 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  43.9 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  45.73 
 
 		 249 aa  137  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  44.85 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  43.03 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  46.34 
 
 		 242 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  50.38 
 
 		 247 aa  136  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  43.9 
 
 		 245 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  44.1 
 
 		 251 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  43.71 
 
 		 243 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  43.71 
 
 		 243 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  45.18 
 
 		 247 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  54.33 
 
 		 243 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  43.03 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  44.85 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0899  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.11 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  49.63 
 
 		 247 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  49.63 
 
 		 247 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  49.62 
 
 		 248 aa  134  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  49.62 
 
 		 248 aa  134  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0113  redoxin  42.77 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  45.4 
 
 		 242 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2558  redoxin domain-containing protein  43.11 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  45.18 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  45.18 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  45.45 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>