181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2631 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  93.39 
 
 		 257 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  93 
 
 		 257 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  81.61 
 
 		 261 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  72.14 
 
 		 262 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  66.53 
 
 		 265 aa  335  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  63.7 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.92 
 
 		 261 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  67.09 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  65.31 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2538  endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.89 
 
 		 260 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  66.94 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  66.12 
 
 		 245 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.38 
 
 		 277 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.9 
 
 		 287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  65.22 
 
 		 264 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  65.22 
 
 		 264 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.82 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  64.08 
 
 		 256 aa  308  8e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  63.11 
 
 		 259 aa  304  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.4 
 
 		 242 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.84 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.78 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.07 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.07 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  57.2 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  57.2 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  57.2 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  57.2 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  57.2 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  57.38 
 
 		 253 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.38 
 
 		 253 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  57.38 
 
 		 253 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  57.38 
 
 		 253 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.38 
 
 		 253 aa  285  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  57.38 
 
 		 253 aa  285  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.79 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  56.97 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  56.97 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  56.56 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.41 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.35 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.93 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  42.91 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  46.19 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  42.51 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.62 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.21 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.85 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.85 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  42.86 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.8 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.57 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.98478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.32 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.32 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  38.17 
 
 		 302 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.34 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.39 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.51 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.74 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.74 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.16 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.42 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.08 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.84 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.76 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  39.29 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  33.74 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  30.94 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0102  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.31 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3049  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.66 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.687036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.32 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3096  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.11 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.11 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.74 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.74 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.74 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.53 
 
 		 271 aa  98.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.84 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0213  hypothetical protein  31.3 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  29.84 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  29.84 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.84 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.84 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3386  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.84 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 		 231 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3294  hypothetical protein  30.87 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.23 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.8 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.92 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.5 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.33 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>